60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1655 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  100 
 
 		 366 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  32.42 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 326 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  27.7 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  29.32 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  32.62 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  32.19 
 
 		 270 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  32.19 
 
 		 270 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  31.88 
 
 		 228 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  31.88 
 
 		 228 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  24.86 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  22.83 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  23.55 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  23.9 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  23.51 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  23.11 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  21.37 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  23.11 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  23.11 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  23.51 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  23.11 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  22.4 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  21.91 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  26.74 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  24.62 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.09 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  22.94 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  26.01 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.09 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  22.1 
 
 		 339 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  20.72 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  28.08 
 
 		 270 aa  52.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  26.49 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.62 
 
 		 467 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  22.61 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  21.24 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  26.42 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1140  phage integrase  31.45 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 420 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.5 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  23.39 
 
 		 444 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  27.59 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  24.81 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  19.47 
 
 		 338 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  20.97 
 
 		 414 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.27 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  23.31 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.31 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.31 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  20.97 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  22.58 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  21.79 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  28.81 
 
 		 451 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  28 
 
 		 182 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>