66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1686 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  97.78 
 
 
270 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  99.56 
 
 
228 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  99.56 
 
 
228 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  82.33 
 
 
368 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  38.69 
 
 
342 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  33.18 
 
 
326 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  32.19 
 
 
366 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 
325 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  29.92 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  29.13 
 
 
338 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  28.17 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  26.05 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  26.82 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  28.15 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  24.68 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  24.26 
 
 
359 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  26.96 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  27.57 
 
 
338 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  24.59 
 
 
342 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  35.71 
 
 
388 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  26.56 
 
 
324 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  24.7 
 
 
339 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  28.18 
 
 
339 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  30.1 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  26.85 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  28.64 
 
 
339 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  27.73 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  28.18 
 
 
339 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  28.18 
 
 
339 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  27.56 
 
 
334 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  26.18 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  30 
 
 
335 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  26.82 
 
 
339 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  26.2 
 
 
340 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  27.51 
 
 
182 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  28.64 
 
 
339 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  29.2 
 
 
346 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  25.86 
 
 
312 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  28.91 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 
352 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  30.57 
 
 
349 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.37 
 
 
383 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  27.84 
 
 
387 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  25.93 
 
 
339 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  26.36 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  29.73 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.8 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  30.77 
 
 
384 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.07 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  31.25 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  26.36 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  25.94 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  25.23 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  27.4 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  25 
 
 
423 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.34 
 
 
400 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26 
 
 
411 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.8 
 
 
344 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  27.53 
 
 
349 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.79 
 
 
385 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  25.99 
 
 
370 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28 
 
 
397 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  33 
 
 
378 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  27.31 
 
 
328 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>