77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0688 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  45.22 
 
 		 356 aa  187  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  45.22 
 
 		 356 aa  188  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  45.22 
 
 		 356 aa  187  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  43.06 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  40.49 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  40.49 
 
 		 359 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  40.49 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  40 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  40 
 
 		 359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  39.01 
 
 		 376 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  38.57 
 
 		 376 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  39.46 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  40.19 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  38.57 
 
 		 376 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  38.57 
 
 		 376 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  38.89 
 
 		 368 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  38.32 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  36.82 
 
 		 375 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  42.54 
 
 		 304 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  37.38 
 
 		 380 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  36.16 
 
 		 385 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  38.21 
 
 		 372 aa  121  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  35.16 
 
 		 372 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  33.65 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  33.18 
 
 		 372 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  31.8 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  28.17 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  35.14 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  34.21 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  34.21 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  56.86 
 
 		 54 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  48.39 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  26.94 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 335 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.45 
 
 		 344 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  32.69 
 
 		 182 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  29.25 
 
 		 412 aa  52  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.5 
 
 		 344 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  29.61 
 
 		 339 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  28.77 
 
 		 339 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  30.52 
 
 		 339 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  28.77 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  28.47 
 
 		 339 aa  49.7  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  30.92 
 
 		 339 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  29.61 
 
 		 339 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  28.77 
 
 		 339 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  28.77 
 
 		 339 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  25 
 
 		 368 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  29.73 
 
 		 333 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  30.58 
 
 		 413 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.02 
 
 		 359 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  25.23 
 
 		 375 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  32.64 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  34.88 
 
 		 319 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  51.06 
 
 		 72 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.17 
 
 		 402 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  23.64 
 
 		 339 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.21 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 417 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  48.94 
 
 		 137 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  48.94 
 
 		 137 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  29.84 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  29.47 
 
 		 365 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  26.94 
 
 		 382 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  33.75 
 
 		 450 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 381 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  25 
 
 		 348 aa  42  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  48.84 
 
 		 349 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  23.66 
 
 		 416 aa  41.6  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>