34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7378 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  41.72 
 
 		 376 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  41.72 
 
 		 376 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  41.72 
 
 		 376 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  41.72 
 
 		 376 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  40.4 
 
 		 376 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  39.46 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  35.14 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  37.42 
 
 		 260 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  41.61 
 
 		 368 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  39.58 
 
 		 362 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  33.33 
 
 		 312 aa  92  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  31.68 
 
 		 394 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  39.6 
 
 		 372 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  39.19 
 
 		 372 aa  90.1  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  39.47 
 
 		 372 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  33.77 
 
 		 372 aa  87  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  36.77 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  37.33 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  36.77 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  36.13 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  36.77 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  34.36 
 
 		 385 aa  81.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  36.13 
 
 		 284 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  36.05 
 
 		 356 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  36.05 
 
 		 356 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  36.05 
 
 		 356 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  35.14 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  39.05 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  39.05 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  30.43 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  78.57 
 
 		 72 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  35.42 
 
 		 119 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  28.32 
 
 		 394 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>