88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2948 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2948  putative phage integrase  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  62.39 
 
 		 409 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  61.17 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  41.28 
 
 		 477 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  39.09 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  36.11 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  38.89 
 
 		 416 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  39.62 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  39.29 
 
 		 414 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  37.76 
 
 		 379 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  37.76 
 
 		 379 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  39.81 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  35.78 
 
 		 431 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  40 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  36.79 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.44 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  36.94 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  32.74 
 
 		 463 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  31 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  36.36 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  41.67 
 
 		 391 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  37.04 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  33.67 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  35.45 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  37.84 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  33.7 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  37.84 
 
 		 422 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  29.7 
 
 		 389 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  37.5 
 
 		 422 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  36.51 
 
 		 406 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.21 
 
 		 390 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  38.54 
 
 		 378 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  37.93 
 
 		 325 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  43.16 
 
 		 429 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  33.77 
 
 		 376 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  37.11 
 
 		 471 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  37.11 
 
 		 471 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  33.9 
 
 		 305 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  33.06 
 
 		 383 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.76 
 
 		 369 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  41.43 
 
 		 357 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  29.76 
 
 		 367 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  33.33 
 
 		 442 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 393 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  32.5 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  44.23 
 
 		 411 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.12 
 
 		 369 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  36.11 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.81 
 
 		 376 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.81 
 
 		 376 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  38.57 
 
 		 275 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  34.65 
 
 		 371 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  32.41 
 
 		 354 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  43.75 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.88 
 
 		 373 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  35.96 
 
 		 404 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  29.76 
 
 		 403 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  38.16 
 
 		 392 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  32.41 
 
 		 377 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.71 
 
 		 369 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  40 
 
 		 411 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  40 
 
 		 411 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  40 
 
 		 411 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  32.65 
 
 		 492 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 388 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  32.11 
 
 		 494 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  31.87 
 
 		 392 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  39.06 
 
 		 444 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  37.97 
 
 		 376 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  29.36 
 
 		 385 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  29.07 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  34.18 
 
 		 340 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  28.87 
 
 		 378 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  30 
 
 		 356 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  29.55 
 
 		 388 aa  41.2  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  32.91 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  38.33 
 
 		 385 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  53.85 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 383 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  34.33 
 
 		 435 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  42.55 
 
 		 428 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  39.34 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  32.11 
 
 		 656 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6234  regulatory protein GntR HTH  32.18 
 
 		 514 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  32.43 
 
 		 379 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.61 
 
 		 370 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  29.73 
 
 		 375 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  32.5 
 
 		 437 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>