More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6234 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6234  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 514 aa  1048    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.78 
 
 		 413 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.68 
 
 		 442 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 393 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  26.2 
 
 		 391 aa  90.9  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.38 
 
 		 376 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.29 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.04 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.72 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0371  hypothetical protein  44.21 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.78 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.58 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.69 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.76 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.21 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.21 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.45 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.95 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.04 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.54 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  31.4 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.02 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.47 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.2 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.12 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  21.03 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.61 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  27.38 
 
 		 508 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  27.38 
 
 		 508 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.46 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.77 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.93 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.5 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.37 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.96 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  21.64 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  26.14 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  30.54 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  22.98 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 451 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  27.91 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  21.62 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  21.72 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  20.94 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.04 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  46.88 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  28.11 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  32.46 
 
 		 201 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  23.48 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  29.51 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  27.64 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  24.51 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.78 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  26.33 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  32.02 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  20.78 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  22.54 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25.83 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 250 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  24.36 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.71 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  21.9 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  21.9 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  21.9 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  31.79 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  25.26 
 
 		 275 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  26.71 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 263 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  44.29 
 
 		 288 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  21.08 
 
 		 391 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  22.27 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  46.55 
 
 		 254 aa  54.7  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  19.54 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 259 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  41.38 
 
 		 213 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18050  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 232 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  23.05 
 
 		 398 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.77 
 
 		 392 aa  53.9  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.67 
 
 		 357 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  22.57 
 
 		 412 aa  53.9  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  20.65 
 
 		 378 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 469 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0432  integrase family protein  26.1 
 
 		 392 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  22.68 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  25.3 
 
 		 305 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  21.13 
 
 		 370 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  24.09 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 280 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  24.15 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>