More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0917 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 288 aa  345  7e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  60.14 
 
 		 288 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0329  transcriptional regulator, GntR family  57.25 
 
 		 289 aa  319  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  48.65 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  32.73 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  45.07 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  47.95 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 500 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 126 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  40.74 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  47.83 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 122 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 115 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  45.88 
 
 		 145 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  40.21 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 111 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0126  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000292092  hitchhiker  0.0000000000517397 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  45.9 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  39.56 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  43.24 
 
 		 517 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.8 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3237  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 117 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  46.27 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  45.9 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  47.54 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  33.03 
 
 		 115 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  31.67 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  35.71 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  43.48 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4808  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>