More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9128 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
250 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  74 
 
 
250 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  57.2 
 
 
259 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  51.87 
 
 
255 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  40.93 
 
 
261 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  40.5 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  38.27 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
257 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  35.95 
 
 
248 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 
259 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  37.05 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 
233 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  30.42 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 
239 aa  85.1  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.09 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 
241 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2896  putative transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407099  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 
259 aa  79  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  29.51 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  29.51 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 
266 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.35 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.92 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
262 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  23.83 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  26.14 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.92 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.17 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  23.25 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  46.38 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  46.38 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  46.38 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  46.38 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  24.29 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  46.38 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  24.29 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  24.29 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.26 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  46.27 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  22.67 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  26.01 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0903  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.634151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3766  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.758694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>