More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12333 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12333  integrase  100 
 
 		 151 aa  303  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  72.14 
 
 		 424 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  49.28 
 
 		 407 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  50.43 
 
 		 370 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  48.74 
 
 		 365 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  41.45 
 
 		 433 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  44.74 
 
 		 397 aa  90.1  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11073  integrase  64.71 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.524499  normal  0.0660642 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  53.57 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  46.15 
 
 		 390 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 402 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  39.24 
 
 		 398 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  51.69 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  37.23 
 
 		 378 aa  62  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13783  integrase  50.85 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.763684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  33.88 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  33.04 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  38.71 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  36.99 
 
 		 416 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  31.3 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  32.67 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  35.94 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  44.78 
 
 		 336 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  40.7 
 
 		 472 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  41.11 
 
 		 379 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0272  phage integrase  34.83 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000104155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  36.89 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  33.33 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.27 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  33.7 
 
 		 363 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  32.99 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  32.99 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  32.99 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  32.58 
 
 		 443 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  32.99 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  35.53 
 
 		 311 aa  53.9  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  37 
 
 		 404 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  39.22 
 
 		 325 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  30.61 
 
 		 469 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  33.08 
 
 		 377 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  33.33 
 
 		 370 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 		 312 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  36.27 
 
 		 298 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  31.93 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  37.04 
 
 		 414 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  34.45 
 
 		 332 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  35.05 
 
 		 307 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.19 
 
 		 325 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  36.76 
 
 		 395 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.64 
 
 		 324 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  38.33 
 
 		 369 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  33.61 
 
 		 328 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.29 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  40.3 
 
 		 332 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.97 
 
 		 404 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  32.22 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  29.5 
 
 		 331 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.29 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  38.16 
 
 		 393 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  36.67 
 
 		 369 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.29 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  36.71 
 
 		 390 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  36.36 
 
 		 396 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  34.19 
 
 		 336 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  31.87 
 
 		 295 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  36.59 
 
 		 294 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  32.2 
 
 		 308 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  32.2 
 
 		 308 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  34.62 
 
 		 380 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  32.2 
 
 		 315 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 351 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  31.86 
 
 		 384 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  37.17 
 
 		 370 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  27.88 
 
 		 301 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  41.77 
 
 		 329 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  32.77 
 
 		 328 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  36.27 
 
 		 363 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.31 
 
 		 298 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  34.29 
 
 		 377 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  33.04 
 
 		 258 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  36.96 
 
 		 291 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  33.63 
 
 		 346 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  35.51 
 
 		 411 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  39.39 
 
 		 367 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.64 
 
 		 311 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  33.02 
 
 		 331 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.27 
 
 		 319 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  31.03 
 
 		 401 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  32.76 
 
 		 335 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  33.02 
 
 		 331 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  35.45 
 
 		 300 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.71 
 
 		 298 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.96 
 
 		 303 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  37.66 
 
 		 385 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.13 
 
 		 297 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  40.54 
 
 		 332 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  35.82 
 
 		 298 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.11 
 
 		 298 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  30.1 
 
 		 388 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2384  integrase family protein  35.04 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>