30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3333 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3333  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  43.37 
 
 		 370 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  42.86 
 
 		 367 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  42.42 
 
 		 407 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  41.57 
 
 		 397 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  42.77 
 
 		 365 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  45.45 
 
 		 433 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  53.12 
 
 		 390 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  38.46 
 
 		 399 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  36.26 
 
 		 402 aa  75.1  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  33.94 
 
 		 424 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11073  integrase  40 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.524499  normal  0.0660642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  35.59 
 
 		 384 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  40.24 
 
 		 370 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  31.37 
 
 		 453 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 368 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  30.88 
 
 		 394 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 395 aa  44.3  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  27.89 
 
 		 451 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 387 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  35.45 
 
 		 451 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 469 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  35.14 
 
 		 395 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  36.9 
 
 		 503 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 385 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  32.29 
 
 		 376 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.45 
 
 		 435 aa  42  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  29.01 
 
 		 336 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12333  integrase  32.89 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  30.19 
 
 		 293 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>