48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1641 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1616  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1641  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.931183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1587  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  653    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.806323  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  41.67 
 
 
402 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  38.58 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  34.65 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  34.75 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  35.65 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.33 
 
 
414 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  27.56 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  30.63 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.63 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  30.92 
 
 
399 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  31.31 
 
 
451 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  26.42 
 
 
426 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.63 
 
 
325 aa  52.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1593  putative tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 
184 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.49 
 
 
392 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.7 
 
 
377 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  37.25 
 
 
377 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  29.84 
 
 
407 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  28.77 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  31.58 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.2 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  26.67 
 
 
453 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25.69 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.1 
 
 
400 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  28.46 
 
 
386 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  31.13 
 
 
477 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.45 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  32.29 
 
 
416 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  32.76 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25 
 
 
390 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  27.52 
 
 
433 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  27.52 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3454  integrase family protein  31.75 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.68 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.42 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.56 
 
 
385 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.95 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  25 
 
 
362 aa  43.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  26.54 
 
 
385 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.41 
 
 
379 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  30.63 
 
 
374 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  27.63 
 
 
381 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.76 
 
 
370 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  28.24 
 
 
379 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>