44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3189 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3189  phage integrase family protein  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000104193  normal  0.041217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  74.25 
 
 		 407 aa  362  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  57.08 
 
 		 414 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  40.8 
 
 		 373 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  40.52 
 
 		 380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  34.3 
 
 		 447 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.89 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.64 
 
 		 385 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.32 
 
 		 409 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  33.66 
 
 		 451 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.84 
 
 		 378 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.04 
 
 		 373 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.56 
 
 		 379 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.49 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  35.62 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  33.64 
 
 		 508 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  33.64 
 
 		 508 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  33.33 
 
 		 451 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  35.51 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 395 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.32 
 
 		 402 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  24.32 
 
 		 370 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.32 
 
 		 401 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.88 
 
 		 383 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  25.9 
 
 		 407 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  25.94 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  23.9 
 
 		 394 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  27.14 
 
 		 463 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  27 
 
 		 378 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 368 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  26.61 
 
 		 494 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  31.37 
 
 		 406 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  26.89 
 
 		 390 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.31 
 
 		 477 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  22.71 
 
 		 392 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  29.45 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  24.2 
 
 		 452 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.7 
 
 		 435 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  25.44 
 
 		 422 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  24.58 
 
 		 439 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  26.17 
 
 		 323 aa  42  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  25.87 
 
 		 380 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>