234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0292 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0292  phage integrase family protein  100 
 
 
354 aa  720    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  76.55 
 
 
356 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  41.19 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  36.54 
 
 
386 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0194  phage integrase  32.49 
 
 
333 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  26.02 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  24.01 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  24.01 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  26.16 
 
 
387 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  25.61 
 
 
387 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.78 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.99 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.99 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  24.44 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  24.46 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  25.53 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  25.15 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  27.98 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  25.36 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  30.17 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  29.53 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  28.65 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  29.17 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  31.22 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  30.34 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  28.75 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  26.04 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  26.04 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  26.04 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  26.04 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  28.63 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  31.67 
 
 
283 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  29.38 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  28.04 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  28.21 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  29.95 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  22.97 
 
 
386 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  31.32 
 
 
322 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  29.24 
 
 
363 aa  62.8  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  28.69 
 
 
286 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  31.05 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  25.96 
 
 
276 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.53 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  26.48 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  28.33 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.05 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  26.14 
 
 
270 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  27.66 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  30 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.89 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  28.7 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.43 
 
 
368 aa  56.6  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  28.08 
 
 
476 aa  56.6  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  24.51 
 
 
387 aa  56.6  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  31.29 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.76 
 
 
296 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  28.05 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  24.7 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  27.06 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  27.06 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  32.4 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  31.11 
 
 
482 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  32.3 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  28.64 
 
 
308 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  30.38 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  26.85 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  30.38 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  30.38 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  33.33 
 
 
637 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  25.28 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  25.57 
 
 
332 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.28 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.67 
 
 
359 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 
443 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.34 
 
 
297 aa  53.5  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.46 
 
 
365 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  25.43 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  30.56 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.63 
 
 
299 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  27.64 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.63 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.63 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.63 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.63 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.63 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.63 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  26.56 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  28.14 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  26.67 
 
 
315 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28.65 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  26.76 
 
 
317 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  28.93 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  28.7 
 
 
337 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  27.73 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  31.46 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  26.52 
 
 
334 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  27.23 
 
 
294 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>