105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6608 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4312  two component regulator propeller domain protein  58.86 
 
 		 747 aa  904    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6608  two component regulator propeller domain protein  100 
 
 		 753 aa  1558    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4310  hypothetical protein  28.89 
 
 		 739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0210749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6607  hypothetical protein  26.94 
 
 		 743 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.71 
 
 		 965 aa  74.7  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  26.44 
 
 		 1250 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  23.57 
 
 		 1374 aa  70.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.09 
 
 		 1346 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  25.36 
 
 		 359 aa  70.1  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  23.77 
 
 		 1327 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  26.95 
 
 		 1008 aa  68.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  23.66 
 
 		 985 aa  68.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  25.45 
 
 		 1397 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  24.11 
 
 		 1005 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  24.9 
 
 		 1355 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  25.08 
 
 		 1347 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  25.48 
 
 		 1378 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  22.01 
 
 		 1384 aa  64.3  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  22.83 
 
 		 1024 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  24.24 
 
 		 946 aa  63.9  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  23.25 
 
 		 1070 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 1258 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  25.27 
 
 		 1374 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  23.15 
 
 		 1335 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.41 
 
 		 1075 aa  62  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.21 
 
 		 1276 aa  61.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  22.64 
 
 		 1054 aa  60.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  23.96 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  21.87 
 
 		 1396 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  30.34 
 
 		 967 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  26.67 
 
 		 1034 aa  60.1  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  21.97 
 
 		 1070 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  24.56 
 
 		 692 aa  60.1  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  23.79 
 
 		 1370 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  25 
 
 		 1366 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  23.67 
 
 		 1086 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  20.83 
 
 		 1351 aa  58.9  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  20.35 
 
 		 976 aa  58.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  23.41 
 
 		 1388 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  23.21 
 
 		 1378 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  23.84 
 
 		 1105 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 1211 aa  58.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  22.42 
 
 		 1340 aa  57.4  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  23.94 
 
 		 987 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  21.74 
 
 		 1093 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  24.15 
 
 		 1316 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  20.68 
 
 		 1363 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  24.01 
 
 		 1355 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 		 1226 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.63 
 
 		 1511 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  23.61 
 
 		 1093 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  20.33 
 
 		 975 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  22.7 
 
 		 1342 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  26.35 
 
 		 1526 aa  55.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 1018 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  25.55 
 
 		 1017 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  23.4 
 
 		 1278 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  25 
 
 		 1084 aa  55.5  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  21.22 
 
 		 1400 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  23.88 
 
 		 1004 aa  54.7  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  22.92 
 
 		 1414 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4115  two component regulator propeller domain-containing protein  22.57 
 
 		 357 aa  54.3  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0684737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  23.79 
 
 		 1494 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  27.23 
 
 		 1374 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.7 
 
 		 1508 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.02 
 
 		 1114 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  25.81 
 
 		 1046 aa  52  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  24.46 
 
 		 1324 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.66 
 
 		 1373 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  26.01 
 
 		 1175 aa  51.6  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  29.55 
 
 		 1334 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  24.37 
 
 		 1407 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004105  signal transduction histidine kinase  22.06 
 
 		 1125 aa  51.2  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 		 1030 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.75 
 
 		 1242 aa  51.2  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  24.76 
 
 		 1278 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.63 
 
 		 1237 aa  50.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  27.09 
 
 		 1347 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  23.57 
 
 		 1306 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  19.71 
 
 		 1376 aa  50.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.41 
 
 		 1453 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  23.15 
 
 		 1344 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  25.55 
 
 		 990 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  25.55 
 
 		 990 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  21.65 
 
 		 1053 aa  48.5  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.48 
 
 		 1486 aa  48.5  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.53 
 
 		 1505 aa  48.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.40172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  22.31 
 
 		 1373 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  30.63 
 
 		 977 aa  48.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  24.26 
 
 		 1515 aa  48.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  24.35 
 
 		 1063 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3143  two component regulator propeller domain protein  21.22 
 
 		 361 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  22.98 
 
 		 1118 aa  47.8  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  21.96 
 
 		 949 aa  47.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  22.95 
 
 		 1313 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0523  hypothetical protein  28.81 
 
 		 329 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.4 
 
 		 1504 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  26.06 
 
 		 1185 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  21.8 
 
 		 1017 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  27.1 
 
 		 1192 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>