150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3632 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  100 
 
 
468 aa  955    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13270  hypothetical protein  29.2 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513426  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  50.63 
 
 
516 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  45.98 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  36.21 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.25 
 
 
1072 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  45 
 
 
634 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.46 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  45 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  45.57 
 
 
1128 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  43.21 
 
 
803 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.31 
 
 
933 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32.04 
 
 
522 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  36.56 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  43.96 
 
 
709 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  39.13 
 
 
672 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  43.04 
 
 
469 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  42.22 
 
 
488 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  48.1 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.2 
 
 
368 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  48.1 
 
 
446 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  44.87 
 
 
1207 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0403  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  25.95 
 
 
419 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  40.78 
 
 
890 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  39.22 
 
 
417 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  40.23 
 
 
566 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  43.24 
 
 
496 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  41.38 
 
 
582 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  40.23 
 
 
1139 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  41.46 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  42.5 
 
 
732 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  44.74 
 
 
492 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  41.38 
 
 
537 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.22 
 
 
507 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  42.5 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  36.52 
 
 
497 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  40.51 
 
 
801 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  41.98 
 
 
603 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.35 
 
 
474 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  37.8 
 
 
492 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  33.98 
 
 
644 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  41.77 
 
 
468 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  37.65 
 
 
495 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  34.65 
 
 
479 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  37.08 
 
 
503 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  42.5 
 
 
452 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  34.44 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  35.96 
 
 
1016 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  36.47 
 
 
535 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  41.25 
 
 
423 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  38.36 
 
 
1222 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.46 
 
 
756 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  32.98 
 
 
411 aa  57  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  43.59 
 
 
1187 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.5 
 
 
472 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  36.71 
 
 
858 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.71 
 
 
858 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.71 
 
 
858 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  39.51 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  40 
 
 
547 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  36.52 
 
 
490 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  38.14 
 
 
801 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  36.71 
 
 
805 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  36.71 
 
 
807 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  36.71 
 
 
800 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  36.71 
 
 
800 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  35.44 
 
 
487 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  37.5 
 
 
576 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  40.79 
 
 
801 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  39.74 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.67 
 
 
627 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  36.05 
 
 
806 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  36.05 
 
 
806 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  36.05 
 
 
806 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  36.05 
 
 
806 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  36.05 
 
 
806 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.05 
 
 
806 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.05 
 
 
806 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  34.34 
 
 
569 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  38.46 
 
 
548 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.77 
 
 
487 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  35.23 
 
 
982 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  37.63 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3760  hypothetical protein  26.04 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  39.74 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  31.91 
 
 
494 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  36.56 
 
 
392 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  34.09 
 
 
412 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  34.48 
 
 
789 aa  53.9  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  38.67 
 
 
430 aa  53.5  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  34.91 
 
 
567 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  35.71 
 
 
957 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  34.62 
 
 
558 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.47 
 
 
500 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  40.24 
 
 
568 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  35.16 
 
 
239 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.33 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  40 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  38.78 
 
 
186 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>