101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5060 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  43.19 
 
 		 1107 aa  805    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  41.21 
 
 		 1127 aa  776    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  38.61 
 
 		 1183 aa  730    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  37.96 
 
 		 1098 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  41.42 
 
 		 1109 aa  768    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  39.3 
 
 		 1098 aa  738    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  46.23 
 
 		 1120 aa  924    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  39.57 
 
 		 1172 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  38.84 
 
 		 1088 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  40.07 
 
 		 1129 aa  753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  38.33 
 
 		 1126 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  43.47 
 
 		 1113 aa  796    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  56.86 
 
 		 1166 aa  1217    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 1161 aa  2378    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  36.98 
 
 		 1203 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  38.38 
 
 		 1208 aa  712    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.16 
 
 		 1114 aa  487  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.09 
 
 		 1228 aa  469  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.91 
 
 		 1246 aa  469  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.1 
 
 		 1236 aa  465  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.98 
 
 		 1170 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.08 
 
 		 1226 aa  454  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.62 
 
 		 1193 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.97 
 
 		 1208 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.19 
 
 		 1192 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.07 
 
 		 1225 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.03 
 
 		 1189 aa  393  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  28.05 
 
 		 573 aa  161  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  28.77 
 
 		 649 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.57 
 
 		 556 aa  153  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.74 
 
 		 604 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  26.92 
 
 		 593 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.58 
 
 		 600 aa  141  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.5 
 
 		 1066 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.56 
 
 		 596 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.92 
 
 		 593 aa  127  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26 
 
 		 585 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  25.46 
 
 		 604 aa  119  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  26.32 
 
 		 583 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.82 
 
 		 951 aa  117  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.74 
 
 		 546 aa  114  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.69 
 
 		 569 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.17 
 
 		 577 aa  107  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  28.22 
 
 		 566 aa  106  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.77 
 
 		 737 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.79 
 
 		 551 aa  105  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.41 
 
 		 574 aa  105  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  26.72 
 
 		 562 aa  95.5  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.4 
 
 		 573 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.38 
 
 		 574 aa  80.1  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.16 
 
 		 668 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.51 
 
 		 554 aa  75.1  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.02 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.8 
 
 		 803 aa  74.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  23.5 
 
 		 655 aa  72  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  24.63 
 
 		 667 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  24.95 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.76 
 
 		 1040 aa  67.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  24.54 
 
 		 658 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1575 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  23.79 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.51 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.03 
 
 		 645 aa  65.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  35 
 
 		 590 aa  65.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.22 
 
 		 657 aa  64.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  27.47 
 
 		 691 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.67 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.96 
 
 		 730 aa  63.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.7 
 
 		 655 aa  61.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  22.89 
 
 		 657 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  26.92 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1127 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.14 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  28.11 
 
 		 878 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.48 
 
 		 2807 aa  55.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  32.28 
 
 		 492 aa  54.3  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  32.11 
 
 		 566 aa  53.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  28.21 
 
 		 681 aa  52.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  25.6 
 
 		 974 aa  52  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.49 
 
 		 655 aa  52  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25 
 
 		 1490 aa  51.6  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  32.58 
 
 		 8871 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.56 
 
 		 677 aa  51.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1289 aa  50.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 1184 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.18 
 
 		 455 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.79 
 
 		 1557 aa  48.9  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  42.67 
 
 		 752 aa  48.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  32.14 
 
 		 506 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.49 
 
 		 604 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.35 
 
 		 1118 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.91 
 
 		 437 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.45 
 
 		 447 aa  46.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  24.61 
 
 		 1124 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 1138 aa  46.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  28 
 
 		 664 aa  46.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.64 
 
 		 3197 aa  45.8  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  28.74 
 
 		 412 aa  45.8  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  25 
 
 		 472 aa  45.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  35.44 
 
 		 662 aa  44.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>