153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4218 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  100 
 
 		 788 aa  1617    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  44.11 
 
 		 669 aa  283  9e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  36.92 
 
 		 623 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  38.55 
 
 		 455 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  38.27 
 
 		 425 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  37.5 
 
 		 311 aa  162  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  34.38 
 
 		 713 aa  160  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  35.79 
 
 		 361 aa  154  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  33.99 
 
 		 318 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  35.61 
 
 		 679 aa  151  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  32.96 
 
 		 712 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  34.93 
 
 		 303 aa  124  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  41.26 
 
 		 351 aa  97.4  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  26.85 
 
 		 601 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  26.98 
 
 		 312 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  27.78 
 
 		 334 aa  87  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  27.96 
 
 		 338 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  32.7 
 
 		 821 aa  85.5  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  38.97 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  38.35 
 
 		 327 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  36.24 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  37.86 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  26.92 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  28.96 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  29.29 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.32 
 
 		 1361 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  41 
 
 		 1862 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  41.67 
 
 		 910 aa  70.5  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  28.78 
 
 		 279 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  31.94 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  33.53 
 
 		 1120 aa  68.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  45.35 
 
 		 1667 aa  67.8  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  31.74 
 
 		 2272 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  43.75 
 
 		 690 aa  67.4  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  39.62 
 
 		 1882 aa  67.4  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.81 
 
 		 2036 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  41.1 
 
 		 540 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  36.23 
 
 		 684 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  30.94 
 
 		 859 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  42.53 
 
 		 752 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1682 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  42 
 
 		 1300 aa  65.1  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  38.95 
 
 		 1094 aa  64.7  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  39.62 
 
 		 1969 aa  64.7  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  36.89 
 
 		 1842 aa  64.7  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  44.87 
 
 		 3295 aa  64.3  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  48.28 
 
 		 2122 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  38 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  40.66 
 
 		 2554 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  40.4 
 
 		 2000 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40.86 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  40.23 
 
 		 791 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  37.86 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  38.04 
 
 		 575 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  50 
 
 		 848 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  30 
 
 		 978 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  46.34 
 
 		 1732 aa  62.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1282 aa  61.6  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  36.89 
 
 		 679 aa  61.6  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  41.86 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  33.06 
 
 		 713 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  39.81 
 
 		 685 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  36.89 
 
 		 669 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  37.4 
 
 		 941 aa  60.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  37.62 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.62 
 
 		 1241 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  29.03 
 
 		 958 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  39.08 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  40.66 
 
 		 1056 aa  59.3  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  36.89 
 
 		 675 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.94 
 
 		 1356 aa  58.9  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  39.36 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  45.24 
 
 		 1236 aa  58.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  42.68 
 
 		 1095 aa  58.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  40.2 
 
 		 930 aa  58.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  36.79 
 
 		 735 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  29.48 
 
 		 658 aa  57.4  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  35.92 
 
 		 581 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  39.78 
 
 		 971 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  36.22 
 
 		 963 aa  57  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 1387 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  41.46 
 
 		 460 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  38.82 
 
 		 184 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  44.94 
 
 		 840 aa  55.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  41.18 
 
 		 1931 aa  55.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  37.78 
 
 		 2176 aa  55.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  36.62 
 
 		 880 aa  55.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  43.94 
 
 		 1328 aa  55.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  27.53 
 
 		 693 aa  54.7  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 951 aa  54.3  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40 
 
 		 1292 aa  54.3  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 		 1380 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  41.25 
 
 		 1528 aa  53.9  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  47.46 
 
 		 1602 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  35.87 
 
 		 1135 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.67 
 
 		 869 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  33.96 
 
 		 958 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  27.91 
 
 		 588 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  35.11 
 
 		 500 aa  52  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>