More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0189 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  881    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.562826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  29.33 
 
 		 446 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  37.16 
 
 		 1034 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  34.59 
 
 		 1219 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  37.35 
 
 		 1132 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1168 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1082 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 1050 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 		 1079 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1028 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1127 aa  73.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 1090 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  35.1 
 
 		 1018 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 1026 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1124 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1084 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1150 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 1050 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1079 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1152 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1154 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  35.95 
 
 		 993 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 		 1053 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1161 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1042 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1064 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  37.75 
 
 		 1055 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1062 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  36.24 
 
 		 1085 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  40.22 
 
 		 1125 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1177 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  35.67 
 
 		 1080 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1046 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1051 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 1144 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1161 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1023 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 999 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1105 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 1011 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1106 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1027 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.63 
 
 		 1041 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1163 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1119 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 1139 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 		 1143 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 1000 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1041 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1146 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  36.43 
 
 		 1117 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 1128 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1119 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1036 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1155 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1023 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1040 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  33.56 
 
 		 1030 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 1189 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1047 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  32.65 
 
 		 1043 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 979 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1198 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1076 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1144 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 1040 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1087 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1094 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  32.65 
 
 		 979 aa  64.3  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1038 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1036 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1079 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1102 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1066 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1129 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 1034 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1155 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1128 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1056 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1113 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  35.1 
 
 		 1095 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1071 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  35.43 
 
 		 1048 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 1033 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 1128 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1049 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1097 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1107 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 1037 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1075 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1085 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1006 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1137 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1053 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  31.74 
 
 		 1065 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1050 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1042 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1021 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1072 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>