More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1810 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  64.18 
 
 		 2554 aa  1068    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 3295 aa  6502    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  73.32 
 
 		 1356 aa  644    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  75.14 
 
 		 1732 aa  1553    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  71.73 
 
 		 1380 aa  611  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  41.83 
 
 		 848 aa  536  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  34.79 
 
 		 1862 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  46.2 
 
 		 823 aa  441  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  52.87 
 
 		 840 aa  422  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  51.33 
 
 		 870 aa  414  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  82.19 
 
 		 361 aa  414  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.94 
 
 		 802 aa  404  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  37.24 
 
 		 1094 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  46.64 
 
 		 845 aa  380  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  37.12 
 
 		 2272 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  42.96 
 
 		 1842 aa  362  7e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  50.24 
 
 		 752 aa  360  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  42.5 
 
 		 930 aa  350  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  47.92 
 
 		 2036 aa  340  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  48.94 
 
 		 1882 aa  340  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  47.78 
 
 		 575 aa  336  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1682 aa  335  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  47.62 
 
 		 978 aa  334  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  47.72 
 
 		 2122 aa  328  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  47.17 
 
 		 2000 aa  327  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  42.13 
 
 		 561 aa  326  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  46.55 
 
 		 1361 aa  325  6e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  47.22 
 
 		 528 aa  325  9.000000000000001e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  38.51 
 
 		 963 aa  321  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  45.23 
 
 		 735 aa  321  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  30.16 
 
 		 1531 aa  310  4.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.42 
 
 		 777 aa  307  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1282 aa  306  6.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  50.15 
 
 		 787 aa  300  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  55.6 
 
 		 1300 aa  293  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  36.52 
 
 		 786 aa  292  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  57.65 
 
 		 859 aa  289  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  38.92 
 
 		 819 aa  287  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  44.58 
 
 		 530 aa  286  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  57.94 
 
 		 1241 aa  285  8.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  58.33 
 
 		 1969 aa  284  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  56.12 
 
 		 1120 aa  284  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  33.47 
 
 		 801 aa  284  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  55.07 
 
 		 581 aa  282  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  54.32 
 
 		 713 aa  280  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  51.83 
 
 		 679 aa  280  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  57.09 
 
 		 675 aa  278  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  57.54 
 
 		 551 aa  277  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  60.75 
 
 		 910 aa  276  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  34.01 
 
 		 838 aa  276  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  57.71 
 
 		 669 aa  275  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  53.46 
 
 		 547 aa  271  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  56.52 
 
 		 615 aa  270  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  55.73 
 
 		 658 aa  270  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  58.27 
 
 		 1667 aa  269  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  53.05 
 
 		 685 aa  267  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  54.94 
 
 		 791 aa  265  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  33.33 
 
 		 941 aa  263  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50.81 
 
 		 460 aa  261  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  40.4 
 
 		 958 aa  259  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  31.79 
 
 		 812 aa  256  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  31.94 
 
 		 1387 aa  253  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  43.31 
 
 		 719 aa  245  7.999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  37.33 
 
 		 1528 aa  241  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  49.06 
 
 		 861 aa  229  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  28.23 
 
 		 1230 aa  223  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  47.88 
 
 		 349 aa  219  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  46.89 
 
 		 682 aa  219  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  45.42 
 
 		 344 aa  215  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  28.17 
 
 		 1152 aa  215  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  44.17 
 
 		 653 aa  207  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  34.3 
 
 		 1783 aa  206  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  46.82 
 
 		 971 aa  205  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  44.62 
 
 		 670 aa  205  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  45.03 
 
 		 2552 aa  204  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  37.65 
 
 		 869 aa  202  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  48.35 
 
 		 930 aa  202  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  52.79 
 
 		 560 aa  197  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  33.82 
 
 		 1011 aa  190  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  54.86 
 
 		 184 aa  189  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  55.42 
 
 		 644 aa  187  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  54.84 
 
 		 1236 aa  187  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  47.16 
 
 		 938 aa  186  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  29.76 
 
 		 952 aa  186  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  42.14 
 
 		 439 aa  185  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  45.27 
 
 		 1095 aa  183  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  30.28 
 
 		 2176 aa  182  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  38.3 
 
 		 320 aa  180  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  32.34 
 
 		 1532 aa  176  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  53.49 
 
 		 1328 aa  174  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  55.79 
 
 		 519 aa  174  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  31.83 
 
 		 1092 aa  173  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  26.66 
 
 		 865 aa  173  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  47.13 
 
 		 443 aa  173  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  47.32 
 
 		 1931 aa  169  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.08 
 
 		 1292 aa  168  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  39.68 
 
 		 276 aa  166  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  44.44 
 
 		 1814 aa  165  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  52.78 
 
 		 735 aa  159  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  42.15 
 
 		 821 aa  158  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>