273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1164 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1164  PKD  100 
 
 
1011 aa  2046    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  35.26 
 
 
1862 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  34.94 
 
 
1094 aa  362  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.74 
 
 
1667 aa  357  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  35.06 
 
 
2272 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  32.02 
 
 
1361 aa  318  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  36.45 
 
 
963 aa  313  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  31.68 
 
 
1667 aa  296  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  33.02 
 
 
941 aa  294  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  36.23 
 
 
1682 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.34 
 
 
1842 aa  273  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  37.87 
 
 
978 aa  272  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.61 
 
 
1282 aa  266  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  38.1 
 
 
561 aa  263  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  28.76 
 
 
1528 aa  261  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  38.72 
 
 
575 aa  237  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.04 
 
 
1882 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  37.95 
 
 
2122 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  38.57 
 
 
2000 aa  233  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  38.06 
 
 
752 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  30.99 
 
 
1783 aa  223  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  37.03 
 
 
735 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  33.51 
 
 
1236 aa  222  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  37.88 
 
 
2036 aa  221  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  30.38 
 
 
2176 aa  221  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  31.33 
 
 
838 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.83 
 
 
2554 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  29.82 
 
 
1387 aa  211  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  35.75 
 
 
528 aa  201  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  36.03 
 
 
1356 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.39 
 
 
859 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  41.03 
 
 
1120 aa  197  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  39.02 
 
 
675 aa  197  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  36.41 
 
 
958 aa  197  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32.49 
 
 
930 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.55 
 
 
1620 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  40.43 
 
 
1300 aa  193  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  36.89 
 
 
530 aa  190  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40.99 
 
 
685 aa  190  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  27.36 
 
 
1814 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.13 
 
 
679 aa  189  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.4 
 
 
1606 aa  187  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  39.75 
 
 
669 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  40.73 
 
 
1969 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  41.18 
 
 
658 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  38.82 
 
 
713 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  39.76 
 
 
1241 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  26.79 
 
 
865 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  27.73 
 
 
952 aa  171  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  37.23 
 
 
861 aa  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  41.73 
 
 
581 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.56 
 
 
1602 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  38.95 
 
 
615 aa  156  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  39.15 
 
 
551 aa  156  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  40.93 
 
 
791 aa  155  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  33.05 
 
 
460 aa  153  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  36.14 
 
 
869 aa  151  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  36.62 
 
 
547 aa  151  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.31 
 
 
3295 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.36 
 
 
1732 aa  147  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  35.24 
 
 
443 aa  146  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.31 
 
 
910 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  35.04 
 
 
971 aa  141  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  28.01 
 
 
840 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  32.45 
 
 
929 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  32.08 
 
 
719 aa  127  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  34.69 
 
 
1095 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  36.43 
 
 
930 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  30.81 
 
 
1292 aa  124  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  29.21 
 
 
734 aa  124  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  29.38 
 
 
1531 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  29.74 
 
 
845 aa  118  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  29.57 
 
 
870 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  30.65 
 
 
1987 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  35.04 
 
 
786 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  35.02 
 
 
802 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  31.94 
 
 
644 aa  115  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  42.95 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  38.95 
 
 
1231 aa  111  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  26.92 
 
 
1389 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  35.44 
 
 
823 aa  108  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  24.26 
 
 
1466 aa  107  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 
819 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  33.86 
 
 
2552 aa  106  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.13 
 
 
777 aa  106  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  32.84 
 
 
1189 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.2 
 
 
1565 aa  104  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  26.86 
 
 
1162 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  37.89 
 
 
400 aa  103  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  29.1 
 
 
519 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  42.86 
 
 
560 aa  102  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  36.93 
 
 
1931 aa  101  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  25.29 
 
 
1057 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  38.95 
 
 
500 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  25.67 
 
 
1371 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  30.3 
 
 
517 aa  98.6  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  38.65 
 
 
996 aa  96.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  31.6 
 
 
938 aa  96.3  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  38.17 
 
 
816 aa  95.5  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  36.12 
 
 
586 aa  91.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>