More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1597 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
797 aa  1594    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 
726 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 
736 aa  309  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.55 
 
 
816 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.4 
 
 
999 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  29.42 
 
 
729 aa  253  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.45 
 
 
901 aa  250  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 
975 aa  231  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
799 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  31.27 
 
 
768 aa  223  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 
910 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  27.15 
 
 
812 aa  213  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  30.03 
 
 
1119 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  32.4 
 
 
916 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  29.51 
 
 
824 aa  207  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 
872 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.52 
 
 
1056 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
798 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 
802 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  31.05 
 
 
701 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.97 
 
 
888 aa  194  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  27.93 
 
 
1125 aa  193  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  31.97 
 
 
887 aa  189  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 
886 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  30.95 
 
 
1085 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 
804 aa  182  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
882 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  27.25 
 
 
792 aa  180  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
781 aa  180  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
1085 aa  180  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  26.87 
 
 
1049 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.48 
 
 
957 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  26.06 
 
 
1097 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  26.98 
 
 
1227 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 
779 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  33.65 
 
 
1005 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  33.76 
 
 
1017 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  28.99 
 
 
1103 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  32.49 
 
 
1102 aa  174  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  26.93 
 
 
1087 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  30.3 
 
 
960 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  30.6 
 
 
1066 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
1137 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  27.27 
 
 
799 aa  169  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  32.17 
 
 
877 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  29.55 
 
 
1043 aa  167  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  31.4 
 
 
840 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  30.59 
 
 
1056 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 
1100 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 
831 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  32.57 
 
 
780 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.6 
 
 
1092 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  31.03 
 
 
1072 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  28.79 
 
 
996 aa  158  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.79 
 
 
952 aa  157  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.85 
 
 
1104 aa  156  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  29.45 
 
 
921 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  28.05 
 
 
1064 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  26.54 
 
 
840 aa  155  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  31.12 
 
 
1001 aa  154  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  30.73 
 
 
1042 aa  154  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  31.09 
 
 
928 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  30.75 
 
 
1036 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  30.59 
 
 
1055 aa  151  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  27.44 
 
 
1044 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.67 
 
 
969 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  30.39 
 
 
1110 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  30.27 
 
 
972 aa  149  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  26.37 
 
 
856 aa  147  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
775 aa  145  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 
1058 aa  145  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  27.58 
 
 
814 aa  144  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
393 aa  144  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  25.82 
 
 
1018 aa  144  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 
1094 aa  144  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 
765 aa  144  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  29.32 
 
 
992 aa  144  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  31.53 
 
 
591 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  27.42 
 
 
776 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  30.4 
 
 
827 aa  140  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  30.41 
 
 
1060 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 
919 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  28.82 
 
 
1010 aa  140  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.01 
 
 
973 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  30.4 
 
 
1050 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
1082 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  29.7 
 
 
601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  27.31 
 
 
950 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 
755 aa  137  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  32.76 
 
 
948 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  27 
 
 
1058 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  29.79 
 
 
658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  30.62 
 
 
591 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  28.77 
 
 
966 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  26.05 
 
 
818 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  29.24 
 
 
943 aa  134  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  26.61 
 
 
760 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  30.73 
 
 
1093 aa  134  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  28.83 
 
 
678 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 
1014 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>