129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4738 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  48.33 
 
 		 1129 aa  1005    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  40.06 
 
 		 1098 aa  746    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  45.85 
 
 		 1088 aa  915    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  43.76 
 
 		 1113 aa  838    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  43.22 
 
 		 1126 aa  830    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  41.17 
 
 		 1166 aa  795    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  60.84 
 
 		 1172 aa  1373    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  40.26 
 
 		 1208 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  41.61 
 
 		 1120 aa  774    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  41.21 
 
 		 1161 aa  774    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  39.54 
 
 		 1107 aa  669    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 1127 aa  2306    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  43.29 
 
 		 1183 aa  847    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  44.46 
 
 		 1098 aa  845    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  40.91 
 
 		 1203 aa  796    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  50 
 
 		 1109 aa  1011    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.85 
 
 		 1114 aa  569  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.62 
 
 		 1236 aa  525  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.98 
 
 		 1228 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.49 
 
 		 1192 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.12 
 
 		 1246 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.36 
 
 		 1170 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.85 
 
 		 1226 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.37 
 
 		 1208 aa  489  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.75 
 
 		 1193 aa  483  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.88 
 
 		 1189 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.31 
 
 		 1225 aa  452  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  32.4 
 
 		 573 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.88 
 
 		 596 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  28.69 
 
 		 604 aa  168  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  27.81 
 
 		 593 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  28.37 
 
 		 556 aa  164  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.16 
 
 		 1066 aa  161  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.73 
 
 		 593 aa  160  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.7 
 
 		 583 aa  154  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.73 
 
 		 649 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.11 
 
 		 574 aa  145  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.29 
 
 		 546 aa  145  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  27.88 
 
 		 577 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.04 
 
 		 585 aa  141  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27 
 
 		 600 aa  134  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.43 
 
 		 569 aa  127  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.6 
 
 		 562 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  27.02 
 
 		 566 aa  122  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.49 
 
 		 604 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.29 
 
 		 573 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  23.76 
 
 		 951 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.81 
 
 		 551 aa  106  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.09 
 
 		 737 aa  105  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  23.92 
 
 		 803 aa  104  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1127 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.26 
 
 		 554 aa  104  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  31.7 
 
 		 574 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.89 
 
 		 1040 aa  99.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1575 aa  98.6  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  27.13 
 
 		 655 aa  97.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.51 
 
 		 521 aa  97.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  24.45 
 
 		 878 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.05 
 
 		 668 aa  90.9  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  25.2 
 
 		 566 aa  88.2  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  24.77 
 
 		 730 aa  85.1  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.44 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.77 
 
 		 585 aa  79.3  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.92 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.88 
 
 		 645 aa  78.2  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  30.85 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  27.99 
 
 		 691 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  24.91 
 
 		 658 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 		 621 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  29.01 
 
 		 1838 aa  69.3  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.97 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.52 
 
 		 1557 aa  67  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  22.24 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.18 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.48 
 
 		 655 aa  63.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  20.99 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  23.65 
 
 		 499 aa  62  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.86 
 
 		 1490 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.52 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  23 
 
 		 620 aa  58.9  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29 
 
 		 1126 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  29.09 
 
 		 590 aa  56.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.86 
 
 		 455 aa  55.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  28.47 
 
 		 482 aa  55.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  27.83 
 
 		 645 aa  53.5  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.7 
 
 		 2807 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  22 
 
 		 685 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  22 
 
 		 685 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  27.06 
 
 		 1976 aa  52.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.57 
 
 		 974 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  30.57 
 
 		 604 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  25.53 
 
 		 1433 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  24.75 
 
 		 1346 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  23.76 
 
 		 1348 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  32.12 
 
 		 1133 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.15 
 
 		 3197 aa  50.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  28.08 
 
 		 681 aa  49.7  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  25.42 
 
 		 1434 aa  49.7  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  25.65 
 
 		 664 aa  49.7  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>