More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2522 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 522 aa  1069    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  38.33 
 
 		 486 aa  302  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  36.7 
 
 		 490 aa  300  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  37.77 
 
 		 476 aa  273  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  37.14 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  34.26 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  34.69 
 
 		 479 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  34.43 
 
 		 499 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  37.18 
 
 		 494 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  36.17 
 
 		 460 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  34.45 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  33.15 
 
 		 494 aa  228  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  33.4 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  34.35 
 
 		 499 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  36.1 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  35.56 
 
 		 477 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  33.9 
 
 		 521 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  34.99 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  32.55 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  33.65 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  32.34 
 
 		 480 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  32.79 
 
 		 501 aa  203  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.7 
 
 		 498 aa  203  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  32.04 
 
 		 500 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  31 
 
 		 477 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.73 
 
 		 494 aa  190  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  31.18 
 
 		 502 aa  190  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 473 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  30.88 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  31.16 
 
 		 527 aa  183  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  30.44 
 
 		 497 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.88 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 497 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  32.73 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.36 
 
 		 508 aa  173  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  31.63 
 
 		 470 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  31.26 
 
 		 513 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  30.05 
 
 		 534 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  29.76 
 
 		 483 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  29.91 
 
 		 511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 549 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 519 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 505 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  30.23 
 
 		 503 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  29.93 
 
 		 507 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  31.59 
 
 		 612 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 494 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 529 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 485 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 527 aa  156  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 540 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 487 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 496 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 508 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 511 aa  150  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  29.17 
 
 		 498 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 488 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  31.36 
 
 		 488 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.37 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 556 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 582 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 601 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  29.66 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 613 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 541 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 503 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 504 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  30.46 
 
 		 461 aa  140  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 664 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 618 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.87 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  31.44 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 603 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 527 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 600 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 512 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 622 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 564 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>