91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2959 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 939 aa  1787    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 923 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  25.9 
 
 		 929 aa  148  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 934 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 931 aa  137  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 927 aa  121  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 944 aa  115  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.61 
 
 		 924 aa  109  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.72 
 
 		 935 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 		 924 aa  99.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 952 aa  91.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  26.31 
 
 		 729 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 900 aa  78.6  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.65 
 
 		 786 aa  76.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.17 
 
 		 883 aa  75.1  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 886 aa  72.8  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  22.73 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 880 aa  65.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 883 aa  65.1  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 955 aa  65.1  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  21.65 
 
 		 940 aa  62.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 917 aa  62  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 884 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  21.63 
 
 		 924 aa  61.6  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.81 
 
 		 603 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 620 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 		 553 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  24.46 
 
 		 573 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 556 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  23.18 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  26.34 
 
 		 520 aa  59.7  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 873 aa  59.7  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  19.13 
 
 		 2059 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  28.15 
 
 		 619 aa  57.4  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.68 
 
 		 887 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 567 aa  56.6  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.31 
 
 		 571 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.09 
 
 		 884 aa  57  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0951  tetratricopeptide TPR_2  29.64 
 
 		 613 aa  56.2  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 827 aa  56.2  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 612 aa  55.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  23.72 
 
 		 931 aa  55.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 		 860 aa  54.3  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  24.67 
 
 		 924 aa  53.9  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.23 
 
 		 882 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1197 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 573 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 585 aa  53.9  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  23.64 
 
 		 824 aa  54.3  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 767 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.4 
 
 		 732 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.95 
 
 		 882 aa  51.6  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  26.44 
 
 		 880 aa  51.2  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.2 
 
 		 573 aa  51.6  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  27.52 
 
 		 918 aa  50.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  26.71 
 
 		 551 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 573 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  29.23 
 
 		 595 aa  50.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 2262 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.47 
 
 		 837 aa  49.7  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 		 582 aa  49.3  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.51 
 
 		 810 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  31.43 
 
 		 864 aa  48.9  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 575 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  29.13 
 
 		 1160 aa  48.9  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1998  uncharacterized protein involved in fimbrial biogenesis  30 
 
 		 267 aa  48.9  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 2262 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 3145 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1676 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  30.91 
 
 		 914 aa  48.5  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 878 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.21 
 
 		 573 aa  48.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.37 
 
 		 582 aa  47.8  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1566  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 		 738 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.411848  hitchhiker  0.00925631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  27.9 
 
 		 584 aa  47.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 374 aa  46.6  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 591 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 562 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 613 aa  46.2  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 599 aa  46.2  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0047  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 788 aa  45.8  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.210348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1085 aa  45.8  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  21.88 
 
 		 937 aa  45.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1404 aa  45.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  28.73 
 
 		 591 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 594 aa  45.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 800 aa  44.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  28.37 
 
 		 625 aa  44.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26.87 
 
 		 648 aa  44.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  28.5 
 
 		 601 aa  44.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>