167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4018 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  100 
 
 		 1275 aa  2477    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  32 
 
 		 1490 aa  222  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  32.13 
 
 		 974 aa  185  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  36.36 
 
 		 2716 aa  179  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.25 
 
 		 1340 aa  178  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.58 
 
 		 2194 aa  174  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  32.17 
 
 		 604 aa  174  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37.07 
 
 		 1019 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.85 
 
 		 1118 aa  170  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  32.3 
 
 		 1126 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.77 
 
 		 1222 aa  167  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.89 
 
 		 2744 aa  159  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.22 
 
 		 1113 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.45 
 
 		 889 aa  155  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.77 
 
 		 1225 aa  148  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.85 
 
 		 1012 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.54 
 
 		 4500 aa  140  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  35.57 
 
 		 828 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.89 
 
 		 4855 aa  135  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  35.18 
 
 		 412 aa  134  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.89 
 
 		 3589 aa  132  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  34.17 
 
 		 872 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.02 
 
 		 891 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  34.34 
 
 		 1838 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  35.56 
 
 		 2927 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.46 
 
 		 2807 aa  122  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.07 
 
 		 1009 aa  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  28.6 
 
 		 2271 aa  118  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1994 aa  114  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  32.03 
 
 		 472 aa  112  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  36.77 
 
 		 469 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  33.55 
 
 		 386 aa  109  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  28.66 
 
 		 3920 aa  109  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  36.98 
 
 		 1241 aa  108  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  35.54 
 
 		 813 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  32.56 
 
 		 1557 aa  105  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  54.24 
 
 		 1779 aa  102  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  42.54 
 
 		 2296 aa  102  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  36.57 
 
 		 2636 aa  101  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  43.44 
 
 		 1830 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  33.8 
 
 		 616 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  58.1 
 
 		 1439 aa  98.2  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  26.02 
 
 		 554 aa  96.3  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  35.23 
 
 		 3197 aa  95.9  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30.39 
 
 		 657 aa  91.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  30.62 
 
 		 1124 aa  91.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1588 aa  90.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  32.92 
 
 		 494 aa  90.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1585 aa  89.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  33.24 
 
 		 485 aa  88.6  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  29.23 
 
 		 447 aa  88.2  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  28.8 
 
 		 4379 aa  88.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.89 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.32 
 
 		 3197 aa  84.7  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  31.55 
 
 		 1526 aa  84.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1289 aa  84  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.78 
 
 		 5613 aa  80.1  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  28.92 
 
 		 917 aa  77.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.74 
 
 		 11716 aa  77  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  26.98 
 
 		 644 aa  76.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.96 
 
 		 959 aa  72  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 		 1372 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  25.65 
 
 		 1527 aa  68.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 1127 aa  68.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1575 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  29.09 
 
 		 690 aa  66.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 		 1154 aa  66.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  31.77 
 
 		 1638 aa  66.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  27.27 
 
 		 1999 aa  65.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.11 
 
 		 1848 aa  65.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.4 
 
 		 1637 aa  64.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  38.68 
 
 		 6272 aa  64.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  29.87 
 
 		 409 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.88 
 
 		 649 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  25.99 
 
 		 437 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.73 
 
 		 1192 aa  63.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  29.32 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.23 
 
 		 583 aa  61.6  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  27.36 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.33 
 
 		 600 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 		 685 aa  60.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.2 
 
 		 1170 aa  60.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.13 
 
 		 556 aa  59.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  24.73 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.3 
 
 		 604 aa  58.9  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.78 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.71 
 
 		 737 aa  58.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.27 
 
 		 1246 aa  58.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  39.13 
 
 		 487 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  27.15 
 
 		 524 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.29 
 
 		 1066 aa  58.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.09 
 
 		 585 aa  57.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  24.42 
 
 		 438 aa  57  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.06 
 
 		 655 aa  56.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  28.82 
 
 		 604 aa  56.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  28.88 
 
 		 837 aa  56.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  28.62 
 
 		 569 aa  55.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  33.81 
 
 		 1245 aa  55.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1328 aa  55.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  40.91 
 
 		 1371 aa  55.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>