More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2431 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 3197 aa  6466    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  90.12 
 
 		 3197 aa  5715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1743 aa  135  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.9 
 
 		 1753 aa  134  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  36.76 
 
 		 1565 aa  131  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.46 
 
 		 1916 aa  126  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  34.48 
 
 		 734 aa  123  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  39.17 
 
 		 552 aa  119  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  33.11 
 
 		 517 aa  116  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  28.81 
 
 		 861 aa  114  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  30.56 
 
 		 1057 aa  106  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  39.53 
 
 		 998 aa  105  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.02 
 
 		 2272 aa  104  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  31.58 
 
 		 1019 aa  104  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  32.01 
 
 		 859 aa  104  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.53 
 
 		 752 aa  103  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.08 
 
 		 735 aa  102  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  36.07 
 
 		 991 aa  102  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  35.14 
 
 		 528 aa  102  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  43.04 
 
 		 816 aa  101  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34.5 
 
 		 1667 aa  101  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  36.22 
 
 		 1771 aa  100  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  31.52 
 
 		 530 aa  99.8  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  32.73 
 
 		 1490 aa  99  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  30.57 
 
 		 679 aa  98.6  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  31.72 
 
 		 1011 aa  97.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  31.13 
 
 		 616 aa  97.1  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.22 
 
 		 889 aa  97.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  31.45 
 
 		 675 aa  97.1  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  32.12 
 
 		 1545 aa  96.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  33.77 
 
 		 581 aa  95.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  33.48 
 
 		 1095 aa  95.5  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  30.83 
 
 		 1528 aa  96.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  41.44 
 
 		 623 aa  94.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  34.91 
 
 		 1094 aa  95.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  29.43 
 
 		 669 aa  94.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  34.68 
 
 		 3295 aa  95.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  29.36 
 
 		 1236 aa  95.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  30.29 
 
 		 929 aa  95.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  27.78 
 
 		 1862 aa  95.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.59 
 
 		 713 aa  94.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  30.77 
 
 		 658 aa  94  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  28.39 
 
 		 2176 aa  94.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  33.79 
 
 		 685 aa  93.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  28.1 
 
 		 2554 aa  93.2  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.05 
 
 		 547 aa  92.8  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1682 aa  92.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.31 
 
 		 974 aa  92.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  37.27 
 
 		 951 aa  91.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  36.96 
 
 		 918 aa  92  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  30.63 
 
 		 551 aa  90.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.64 
 
 		 872 aa  90.9  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  28.23 
 
 		 2122 aa  90.9  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  33.77 
 
 		 719 aa  90.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  31.67 
 
 		 791 aa  90.1  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  28.8 
 
 		 561 aa  90.1  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  33.22 
 
 		 1275 aa  90.1  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.09 
 
 		 2194 aa  90.1  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  31.94 
 
 		 1557 aa  90.1  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  32.49 
 
 		 963 aa  89.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  31.44 
 
 		 845 aa  89.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  33.61 
 
 		 938 aa  89  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  34.63 
 
 		 786 aa  89.4  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  45.14 
 
 		 995 aa  89.4  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.64 
 
 		 1340 aa  88.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  30.48 
 
 		 1300 aa  88.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  30.2 
 
 		 1842 aa  88.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.49 
 
 		 930 aa  88.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  31.67 
 
 		 460 aa  88.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.55 
 
 		 792 aa  88.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33 
 
 		 891 aa  87.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  31.48 
 
 		 838 aa  87.8  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1667 aa  87.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.85 
 
 		 1118 aa  88.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  30.74 
 
 		 870 aa  87.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.42 
 
 		 2036 aa  87.4  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.17 
 
 		 699 aa  87.4  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  30.61 
 
 		 1120 aa  87  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  30.97 
 
 		 1838 aa  87.4  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.94 
 
 		 1113 aa  87  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.38 
 
 		 604 aa  87  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  28.53 
 
 		 978 aa  87  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  31.7 
 
 		 958 aa  86.7  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.1 
 
 		 1620 aa  86.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  31.38 
 
 		 869 aa  86.7  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.95 
 
 		 1225 aa  85.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  32.89 
 
 		 2169 aa  86.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  32.59 
 
 		 1732 aa  85.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  28.49 
 
 		 575 aa  85.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  29.96 
 
 		 1011 aa  85.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  29.48 
 
 		 1882 aa  84.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  40.43 
 
 		 317 aa  84  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  37.04 
 
 		 873 aa  84  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  29.08 
 
 		 6276 aa  83.6  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.71 
 
 		 1606 aa  84  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  34.84 
 
 		 1356 aa  84  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  29.32 
 
 		 1783 aa  83.6  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  27.31 
 
 		 2066 aa  83.2  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  30 
 
 		 615 aa  83.2  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  30.34 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>