141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2217 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2217  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1075    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2220  hypothetical protein  22.41 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 501 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 497 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.09 
 
 		 494 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  22.76 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.2 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  22.93 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  22.13 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  22.41 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 519 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  22.52 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  23.01 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  23.15 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  22.86 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  23.91 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  23.33 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  24.06 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  21.03 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  22.79 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  21.66 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  21.73 
 
 		 493 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  19.88 
 
 		 488 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 470 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 618 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  21.57 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  22.28 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 565 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1778  RagB/SusD domain protein  21.03 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0496673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  21.15 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.84 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  21.64 
 
 		 507 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  40.51 
 
 		 491 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  22.77 
 
 		 513 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  22.78 
 
 		 506 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 512 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 490 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 524 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  19.67 
 
 		 504 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 475 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  25.09 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  22.39 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  22.47 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  21.69 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  22.54 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  38.24 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 522 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  33.9 
 
 		 497 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  37.5 
 
 		 548 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  21.11 
 
 		 480 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1782  RagB/SusD domain protein  21.22 
 
 		 510 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  37.5 
 
 		 533 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  22.97 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  23.49 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  20.79 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  22.46 
 
 		 532 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  23.46 
 
 		 527 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  36.47 
 
 		 642 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>