267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1696 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 524 aa  1087    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 528 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 559 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 554 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.59 
 
 		 527 aa  243  7e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 556 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  31.82 
 
 		 529 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 547 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 564 aa  197  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 561 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 555 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 531 aa  187  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 533 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 523 aa  181  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.47 
 
 		 545 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.52 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 531 aa  174  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 530 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 518 aa  170  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.68 
 
 		 556 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 523 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.42 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 530 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 530 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 523 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 534 aa  163  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.22 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 528 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 536 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  29.53 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 531 aa  159  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 534 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 536 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 516 aa  153  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 535 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 552 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  29.82 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  29.64 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 532 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  29.29 
 
 		 527 aa  143  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 580 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  27.12 
 
 		 531 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 537 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  28.65 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 531 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 532 aa  137  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  27.02 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  26.41 
 
 		 476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  27.03 
 
 		 530 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 476 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  25.43 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  25.19 
 
 		 476 aa  124  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 560 aa  121  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 545 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 506 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 536 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 517 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  25.05 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 484 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  25.1 
 
 		 479 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  25.1 
 
 		 472 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  25.2 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 505 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  28.2 
 
 		 526 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  24.25 
 
 		 494 aa  93.6  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.05 
 
 		 548 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 551 aa  91.3  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  23.89 
 
 		 598 aa  90.1  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.77 
 
 		 511 aa  88.2  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>