175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3022 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1329    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  28.81 
 
 		 672 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.45 
 
 		 1072 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  31.02 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  31.02 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  31.02 
 
 		 300 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.1 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.72 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.65 
 
 		 982 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  30.82 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  34.97 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  24.01 
 
 		 858 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  23.4 
 
 		 1207 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  28.8 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.39 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.38 
 
 		 1567 aa  70.5  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  23.68 
 
 		 805 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  23.68 
 
 		 807 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  23.68 
 
 		 858 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  23.68 
 
 		 800 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  23.68 
 
 		 858 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  23.68 
 
 		 800 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  32.37 
 
 		 863 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  31.22 
 
 		 900 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  31.79 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  30.83 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  28.69 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  26.15 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  26.15 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  26.15 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  31.69 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  26.15 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  31.85 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  25.17 
 
 		 1128 aa  67.4  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  26.15 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  23.48 
 
 		 963 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  28.33 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  32.12 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.94 
 
 		 933 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.77 
 
 		 1259 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  35.43 
 
 		 732 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  25.31 
 
 		 737 aa  63.9  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  29.05 
 
 		 1139 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  26.81 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  29.32 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 634 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  24.89 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  29.71 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35.71 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  29.08 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  28.74 
 
 		 417 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  28.12 
 
 		 489 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.46 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  27.41 
 
 		 240 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  27.89 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  26.1 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  30.56 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  26.23 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  27.04 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  30.66 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  28.48 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  32.28 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  27.66 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  29.86 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.56 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  28.68 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  28.28 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  28.15 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  27.59 
 
 		 801 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  27.33 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  35.8 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  26.38 
 
 		 627 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.5 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  25.64 
 
 		 451 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  33.09 
 
 		 401 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  27.38 
 
 		 1187 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  27.81 
 
 		 567 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  27.82 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  33.93 
 
 		 492 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  31.75 
 
 		 384 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 330 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  23.41 
 
 		 748 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  31.62 
 
 		 537 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  28.12 
 
 		 472 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 186 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  31.2 
 
 		 275 aa  55.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  28.67 
 
 		 1016 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  27.22 
 
 		 427 aa  55.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  28.15 
 
 		 468 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  31.21 
 
 		 582 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  24.36 
 
 		 653 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  24.81 
 
 		 374 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  28.89 
 
 		 1222 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>