More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1918 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  82.85 
 
 		 515 aa  827    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  100 
 
 		 501 aa  987    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  81.4 
 
 		 531 aa  775    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  75.3 
 
 		 509 aa  730    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  75.15 
 
 		 503 aa  729    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  82.85 
 
 		 515 aa  828    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  83.04 
 
 		 515 aa  827    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  86.51 
 
 		 520 aa  831    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  77.05 
 
 		 505 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  86.17 
 
 		 517 aa  827    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  73.56 
 
 		 521 aa  713    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  73.05 
 
 		 516 aa  701    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  86.31 
 
 		 520 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  70.18 
 
 		 505 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  82.85 
 
 		 515 aa  828    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  76.39 
 
 		 495 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  53.32 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  47.29 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  50.11 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  48.75 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  47.86 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  44.85 
 
 		 459 aa  353  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  45.02 
 
 		 451 aa  349  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  40.37 
 
 		 483 aa  349  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  42.29 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  44.57 
 
 		 453 aa  337  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  42.47 
 
 		 481 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  44.6 
 
 		 479 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  44.37 
 
 		 493 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  44.6 
 
 		 493 aa  306  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  44.34 
 
 		 481 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.49 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 458 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  30.54 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  32.71 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  30.25 
 
 		 453 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 462 aa  170  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  30.28 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 451 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 453 aa  143  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 452 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 453 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 452 aa  136  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 477 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  24.88 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  25.17 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 452 aa  128  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 455 aa  128  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 466 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.63 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  25.54 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  25.46 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  25.95 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.13 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  27.67 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 438 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 438 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 445 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  29.02 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  23.18 
 
 		 455 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 440 aa  106  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.72 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.87 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>