More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6834 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 921 aa  1855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  58.09 
 
 		 950 aa  1045    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  43.27 
 
 		 972 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 961 aa  439  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.28 
 
 		 966 aa  416  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 1001 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 1010 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  33.73 
 
 		 946 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 959 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  43.15 
 
 		 877 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  44.36 
 
 		 591 aa  366  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 973 aa  362  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 973 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 591 aa  361  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 973 aa  361  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 950 aa  360  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40.03 
 
 		 658 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  43.26 
 
 		 601 aa  359  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 1014 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  31.54 
 
 		 956 aa  354  5e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 948 aa  353  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 928 aa  351  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  43.07 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  43.07 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 618 aa  337  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 954 aa  314  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 948 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 493 aa  298  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 493 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 493 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 953 aa  290  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 481 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 		 906 aa  281  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 468 aa  269  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.46 
 
 		 1085 aa  268  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  38.6 
 
 		 999 aa  265  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 781 aa  265  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 1066 aa  264  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  43.05 
 
 		 502 aa  264  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  44.13 
 
 		 887 aa  261  6e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 1085 aa  251  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.04 
 
 		 701 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  31.66 
 
 		 922 aa  248  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  41.97 
 
 		 1017 aa  248  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  30.11 
 
 		 901 aa  246  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 1137 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 490 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.36 
 
 		 1042 aa  244  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 886 aa  244  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.4 
 
 		 1050 aa  241  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 882 aa  241  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  38.55 
 
 		 799 aa  241  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.56 
 
 		 1055 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.55 
 
 		 1102 aa  238  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.53 
 
 		 960 aa  238  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  32.22 
 
 		 975 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.78 
 
 		 1056 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  39.9 
 
 		 1087 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.23 
 
 		 1049 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 		 1100 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 1058 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 814 aa  232  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.85 
 
 		 1125 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.39 
 
 		 792 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.19 
 
 		 1060 aa  229  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.83 
 
 		 1092 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  37.47 
 
 		 1119 aa  228  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.99 
 
 		 1103 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.54 
 
 		 816 aa  226  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  36.07 
 
 		 840 aa  225  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.66 
 
 		 1072 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  40.18 
 
 		 824 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  35.76 
 
 		 765 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 775 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 931 aa  221  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 952 aa  220  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 1093 aa  218  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  38.62 
 
 		 760 aa  218  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 818 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 888 aa  214  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.46 
 
 		 1064 aa  213  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 		 1094 aa  211  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 504 aa  210  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  31.15 
 
 		 1058 aa  210  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.16 
 
 		 1036 aa  210  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.99 
 
 		 1043 aa  210  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 901 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  43.07 
 
 		 969 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.94 
 
 		 1227 aa  208  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 957 aa  208  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.18 
 
 		 827 aa  207  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  35.67 
 
 		 916 aa  205  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 1082 aa  204  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.97 
 
 		 1110 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.4 
 
 		 1097 aa  203  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  33.11 
 
 		 776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  43.73 
 
 		 1158 aa  198  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 812 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 878 aa  197  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>