218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3629 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  35.17 
 
 		 828 aa  441  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  34.22 
 
 		 829 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  33.22 
 
 		 849 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  25.22 
 
 		 930 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  29.81 
 
 		 905 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  29.6 
 
 		 854 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  24.17 
 
 		 828 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  24.33 
 
 		 843 aa  144  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  24.44 
 
 		 839 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  24.18 
 
 		 848 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  24.14 
 
 		 841 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  23.83 
 
 		 853 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  22.46 
 
 		 925 aa  116  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  24.22 
 
 		 855 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  22.76 
 
 		 856 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  24.55 
 
 		 853 aa  109  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  22.85 
 
 		 838 aa  109  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  23.2 
 
 		 857 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 790 aa  71.2  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 787 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 975 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  21.39 
 
 		 877 aa  64.3  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1018 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 775 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1008 aa  62.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  28.03 
 
 		 803 aa  62.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 753 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 833 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1081 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1013 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 1078 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1011 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1020 aa  58.5  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 789 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 922 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  22.18 
 
 		 831 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1114 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 759 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  27.67 
 
 		 800 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  32.26 
 
 		 872 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 793 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1033 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1064 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  27.03 
 
 		 827 aa  55.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  31.09 
 
 		 833 aa  55.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 1102 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1059 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1176 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1050 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 1005 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1034 aa  55.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1096 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 788 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 958 aa  54.3  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1040 aa  54.3  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 882 aa  54.7  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 812 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 999 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 795 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 971 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  41.67 
 
 		 1181 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1168 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1127 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 907 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 984 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1053 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  30.17 
 
 		 381 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  31.87 
 
 		 1010 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1046 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 806 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  22.37 
 
 		 814 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1047 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1103 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1042 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1107 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 800 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 716 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1117 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 1083 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 806 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  20.62 
 
 		 1081 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1155 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1079 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  29.52 
 
 		 1047 aa  51.2  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 1089 aa  51.2  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 988 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 1049 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 897 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1079 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1016 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1016 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1082 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1165 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1006 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 814 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1142 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 791 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 982 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1076 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>