More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52607 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  35.61 
 
 		 1215 aa  691    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  37.34 
 
 		 1208 aa  706    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  100 
 
 		 1232 aa  2512    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  35.7 
 
 		 1209 aa  678    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  32.45 
 
 		 1011 aa  460  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 		 1171 aa  234  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.47 
 
 		 1149 aa  220  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1147 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  22.7 
 
 		 1171 aa  216  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.29 
 
 		 1174 aa  213  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 		 1188 aa  210  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 		 1188 aa  210  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.2 
 
 		 1192 aa  207  9e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 		 1187 aa  206  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  22.9 
 
 		 1189 aa  201  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  24.16 
 
 		 1188 aa  199  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  23.44 
 
 		 1187 aa  197  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  22.44 
 
 		 1189 aa  196  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  22.92 
 
 		 1189 aa  196  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1146 aa  196  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  23.82 
 
 		 1187 aa  188  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  22.51 
 
 		 1177 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  22.65 
 
 		 1191 aa  183  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  23.45 
 
 		 1170 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  21.62 
 
 		 1196 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.3 
 
 		 1153 aa  174  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  23.22 
 
 		 1181 aa  171  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  26.28 
 
 		 1179 aa  170  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  22.83 
 
 		 1196 aa  166  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  20.8 
 
 		 1174 aa  162  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  21.74 
 
 		 1179 aa  161  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 		 1226 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  22.98 
 
 		 1177 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  24.54 
 
 		 1191 aa  158  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  21.77 
 
 		 1172 aa  157  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.44 
 
 		 1226 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23.1 
 
 		 1190 aa  155  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  22.39 
 
 		 1178 aa  154  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  22.64 
 
 		 1186 aa  152  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  22.87 
 
 		 1186 aa  152  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  21.98 
 
 		 1184 aa  151  9e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  24.03 
 
 		 1186 aa  149  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.37 
 
 		 1146 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.2 
 
 		 1201 aa  147  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  22.53 
 
 		 1476 aa  146  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  22.67 
 
 		 1179 aa  146  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.35 
 
 		 1175 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  23.82 
 
 		 1134 aa  146  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  20.96 
 
 		 1177 aa  142  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  23.33 
 
 		 1193 aa  141  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24 
 
 		 1189 aa  141  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  24.47 
 
 		 1204 aa  140  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  24.18 
 
 		 1198 aa  140  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  21.3 
 
 		 1178 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.96 
 
 		 1189 aa  138  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  23.96 
 
 		 1189 aa  137  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  20.92 
 
 		 1185 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  22.53 
 
 		 1217 aa  137  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  23.21 
 
 		 1185 aa  135  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 		 1204 aa  131  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  23.34 
 
 		 1167 aa  131  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  23.73 
 
 		 1189 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  24.44 
 
 		 1189 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  22.75 
 
 		 1183 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  23.73 
 
 		 1189 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  24.73 
 
 		 1189 aa  131  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  24.44 
 
 		 1189 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  24.44 
 
 		 1189 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  24.44 
 
 		 1189 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  24.23 
 
 		 1189 aa  129  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.67 
 
 		 1196 aa  129  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.76 
 
 		 1196 aa  128  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  24.69 
 
 		 1146 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  23.58 
 
 		 1189 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  24.21 
 
 		 1148 aa  126  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  23.07 
 
 		 1308 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  21.83 
 
 		 1185 aa  125  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  20.81 
 
 		 1190 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  20.83 
 
 		 1176 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44736  predicted protein  45.9 
 
 		 153 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0727103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  23.54 
 
 		 1403 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1184 aa  119  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  27.66 
 
 		 1200 aa  115  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  22.49 
 
 		 1185 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  23.19 
 
 		 1185 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  23.14 
 
 		 1190 aa  112  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  24.83 
 
 		 1213 aa  111  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  22.81 
 
 		 1170 aa  110  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 		 1171 aa  110  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  27.08 
 
 		 1215 aa  109  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  32.75 
 
 		 1175 aa  109  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 		 1204 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  23.47 
 
 		 1540 aa  106  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  30.68 
 
 		 1182 aa  107  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  20.96 
 
 		 1174 aa  106  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  29.23 
 
 		 1175 aa  106  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 		 1171 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 		 1190 aa  105  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 		 1174 aa  105  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 		 1174 aa  105  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>