122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4235 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  72.48 
 
 		 491 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  72.48 
 
 		 491 aa  700    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  88.38 
 
 		 482 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  72.06 
 
 		 476 aa  697    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  951    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  69.41 
 
 		 480 aa  645    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  53.63 
 
 		 496 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  54.19 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  53.99 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  50.31 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  53.22 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  50.94 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  49.79 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  49.27 
 
 		 482 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  45.73 
 
 		 487 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 515 aa  329  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  41.91 
 
 		 506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  41.81 
 
 		 473 aa  326  6e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 476 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 		 474 aa  322  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  43.01 
 
 		 466 aa  316  7e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  41.2 
 
 		 474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 		 478 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 		 481 aa  306  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  41.2 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  42.71 
 
 		 469 aa  300  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 		 484 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  40.3 
 
 		 465 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  44.58 
 
 		 505 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  40.34 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  35.49 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  38.2 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 491 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  52.08 
 
 		 568 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.49 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.76 
 
 		 477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  42.41 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  43.7 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 		 474 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.77 
 
 		 511 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  37.72 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 524 aa  217  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 528 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 530 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.42 
 
 		 545 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 531 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 534 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 526 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  31.2 
 
 		 530 aa  130  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 528 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 522 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 580 aa  93.6  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  25.23 
 
 		 535 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 533 aa  91.3  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 554 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.44 
 
 		 556 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  25.92 
 
 		 533 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 536 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  21.9 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  21.44 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 514 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  28.17 
 
 		 545 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.34 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  22.11 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  20.18 
 
 		 564 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 523 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  29.21 
 
 		 532 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 552 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.14 
 
 		 527 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  26.59 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  28.65 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>