More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2114 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 872 aa  1763    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.78 
 
 		 816 aa  313  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 975 aa  301  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 901 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 736 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 799 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 726 aa  268  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  30.31 
 
 		 768 aa  263  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 798 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 910 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 802 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  26.76 
 
 		 999 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 812 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 888 aa  227  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  26.16 
 
 		 1125 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 781 aa  225  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  27.58 
 
 		 1227 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 831 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  29.06 
 
 		 779 aa  209  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  26.83 
 
 		 1102 aa  207  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  28.22 
 
 		 886 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  27.12 
 
 		 797 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  27.13 
 
 		 1119 aa  200  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  27.27 
 
 		 792 aa  199  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  26.22 
 
 		 1092 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  27.01 
 
 		 1056 aa  197  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  26.4 
 
 		 776 aa  194  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  28.43 
 
 		 1055 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  25.61 
 
 		 824 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  29.53 
 
 		 916 aa  190  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 1085 aa  190  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  29.64 
 
 		 1005 aa  190  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  26.11 
 
 		 701 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 775 aa  187  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  25.04 
 
 		 1085 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  26.24 
 
 		 799 aa  184  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  25.41 
 
 		 1103 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  29.31 
 
 		 960 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  28.97 
 
 		 992 aa  180  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 729 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  26.6 
 
 		 840 aa  178  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  25.93 
 
 		 1017 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 882 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  24.74 
 
 		 1087 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  26.94 
 
 		 1049 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 755 aa  173  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  26.72 
 
 		 1058 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 		 1066 aa  173  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.59 
 
 		 1104 aa  172  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 1050 aa  171  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 1137 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  24.69 
 
 		 1097 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  29.37 
 
 		 678 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  25.56 
 
 		 957 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  29.95 
 
 		 1056 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  24.78 
 
 		 1050 aa  164  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 887 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  27.08 
 
 		 780 aa  164  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  30.34 
 
 		 1036 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1062  transcriptional regulator, LuxR family  26.41 
 
 		 933 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 814 aa  158  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  29.09 
 
 		 1072 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  28.48 
 
 		 765 aa  157  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  29.25 
 
 		 1110 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 953 aa  156  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  26.68 
 
 		 950 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  26.42 
 
 		 921 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  25.2 
 
 		 840 aa  151  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  29.49 
 
 		 931 aa  151  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  26.09 
 
 		 1042 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 877 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  26.85 
 
 		 961 aa  148  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 1043 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  26.75 
 
 		 996 aa  148  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 966 aa  148  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 601 aa  148  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  29.11 
 
 		 644 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 928 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 601 aa  144  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 601 aa  144  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  26.1 
 
 		 818 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  27.42 
 
 		 1058 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 952 aa  142  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 1064 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  28.48 
 
 		 1100 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 959 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  28.74 
 
 		 1064 aa  140  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 919 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 973 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  29.62 
 
 		 948 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  24.38 
 
 		 856 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 973 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 948 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  28.5 
 
 		 1076 aa  137  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  30.45 
 
 		 1158 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 973 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  24.67 
 
 		 1093 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  27.27 
 
 		 760 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 950 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>