More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1866 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
812 aa  1660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 
910 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  32.49 
 
 
901 aa  316  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 
831 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 
802 aa  256  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 
975 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 
768 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.14 
 
 
999 aa  249  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.06 
 
 
816 aa  248  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  30.68 
 
 
779 aa  245  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  35.13 
 
 
798 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  29.8 
 
 
804 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
799 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
726 aa  231  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
781 aa  229  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.96 
 
 
1066 aa  227  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  33.49 
 
 
916 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  28.08 
 
 
1125 aa  218  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.26 
 
 
1085 aa  217  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  28.22 
 
 
1092 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  28.59 
 
 
824 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
736 aa  214  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  34.69 
 
 
1072 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  29.62 
 
 
1102 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  29.37 
 
 
888 aa  211  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  29.01 
 
 
886 aa  208  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  27.15 
 
 
797 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  34.8 
 
 
887 aa  207  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  27.92 
 
 
1227 aa  206  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 
872 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  28.99 
 
 
1056 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
1137 aa  201  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  27.17 
 
 
1087 aa  201  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  28.06 
 
 
799 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  31.37 
 
 
1097 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 
1058 aa  197  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 
729 aa  197  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  25.59 
 
 
1050 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
882 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.17 
 
 
1043 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  28.84 
 
 
792 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
775 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  31.55 
 
 
877 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  30.06 
 
 
1056 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  27.56 
 
 
1103 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  29.71 
 
 
701 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  31.73 
 
 
1049 aa  194  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  31.37 
 
 
1100 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 
921 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 
957 aa  187  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  29.37 
 
 
950 aa  185  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  28.73 
 
 
1055 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
1085 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  32.13 
 
 
972 aa  181  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  32.54 
 
 
1042 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  31.45 
 
 
1119 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  27.02 
 
 
1058 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  34.77 
 
 
951 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  28.89 
 
 
943 aa  178  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  29.23 
 
 
1094 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  32.98 
 
 
1017 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.5 
 
 
952 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  32.99 
 
 
1010 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
814 aa  173  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  25.59 
 
 
776 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  26.91 
 
 
840 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  30.38 
 
 
1036 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  27.1 
 
 
961 aa  171  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  27.85 
 
 
966 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 
765 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  28.51 
 
 
1001 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  30.32 
 
 
1110 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  26.46 
 
 
996 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  28.44 
 
 
591 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  28.54 
 
 
1060 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  28.67 
 
 
755 aa  165  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.49 
 
 
1093 aa  165  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
1082 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  26.56 
 
 
960 aa  165  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  27.91 
 
 
591 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  29.13 
 
 
601 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  26.12 
 
 
1044 aa  161  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  32.22 
 
 
658 aa  161  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  25.9 
 
 
777 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  29.95 
 
 
1158 aa  160  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 
919 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  29.93 
 
 
954 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 
818 aa  159  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  32.36 
 
 
938 aa  158  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  29.02 
 
 
760 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  30.71 
 
 
1005 aa  158  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  31.65 
 
 
953 aa  158  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  28.89 
 
 
928 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  31.87 
 
 
931 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  31.32 
 
 
827 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  27.27 
 
 
678 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  26.17 
 
 
780 aa  156  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  28.9 
 
 
601 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  28.9 
 
 
601 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  28.37 
 
 
922 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>