More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0199 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 511 aa  1066    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  47.15 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  32.33 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  32.59 
 
 		 489 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  31.43 
 
 		 529 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.6 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 600 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 531 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 561 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 579 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 584 aa  170  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.69 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 594 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.98 
 
 		 476 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 541 aa  163  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  32.48 
 
 		 568 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.81 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 593 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 498 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 557 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 555 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 564 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 571 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  28.84 
 
 		 566 aa  146  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 579 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 506 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 486 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 507 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  30.41 
 
 		 568 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 508 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 480 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.23 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 584 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 520 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 511 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  27.75 
 
 		 531 aa  133  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 557 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 512 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.78 
 
 		 498 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 		 540 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 587 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 559 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 503 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 499 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 583 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  32.16 
 
 		 506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 508 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 519 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 550 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 582 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 568 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 519 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 494 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 556 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 594 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.27 
 
 		 490 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 615 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 498 aa  117  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 582 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 549 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 503 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>