231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2011 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 408 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  61.28 
 
 		 404 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  52.84 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  52.01 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  40.26 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  35.54 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  33.62 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  31.71 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  32.98 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  30.08 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  33.54 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  28.99 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  28.06 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  34.81 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  22.67 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  45.78 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  28.08 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  41.86 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  54.1 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  49.18 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  48.65 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  36.57 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  50.82 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  50.85 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  49.18 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  41.67 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  54.1 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  49.21 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  49.18 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  49.18 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  49.18 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  39.53 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  27.97 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  46.03 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  50.82 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  28.21 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  41.79 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  54.1 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  52.46 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  25.19 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  47.54 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  47.37 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  39.33 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 		 429 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  31.87 
 
 		 393 aa  57  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  30.83 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 425 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  44.12 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  45.16 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  50.88 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  28.82 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  50.82 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  43.04 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  49.18 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  29.04 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  44.26 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  24.71 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  34.45 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  37.65 
 
 		 458 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  43.84 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  47.69 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 563 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  26.08 
 
 		 464 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 501 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  45.9 
 
 		 473 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  43.84 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  29.51 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  47.54 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  59.09 
 
 		 681 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  35.79 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  52.08 
 
 		 538 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 558 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  56.86 
 
 		 540 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 552 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  36.47 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  44.23 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  44.23 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  44.23 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>