More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1688 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 		 1188 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  34.28 
 
 		 1189 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  34.14 
 
 		 1189 aa  645    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  38.14 
 
 		 1190 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  34.14 
 
 		 1189 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  34.2 
 
 		 1189 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  34.2 
 
 		 1189 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  33.93 
 
 		 1189 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  34.82 
 
 		 1187 aa  668    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  33.77 
 
 		 1189 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  34.2 
 
 		 1189 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  39.52 
 
 		 1196 aa  730    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.93 
 
 		 1189 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 		 1188 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  34.04 
 
 		 1189 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  33.12 
 
 		 1190 aa  658    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  35.95 
 
 		 1187 aa  707    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  34.15 
 
 		 1189 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  98.06 
 
 		 1185 aa  2256    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1185 aa  2297    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  34.36 
 
 		 1198 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.76 
 
 		 1186 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  34.7 
 
 		 1189 aa  631  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  35.06 
 
 		 1179 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  32.6 
 
 		 1187 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  32.71 
 
 		 1174 aa  605  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  34.79 
 
 		 1185 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  33.23 
 
 		 1177 aa  589  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  34.38 
 
 		 1177 aa  571  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  34 
 
 		 1191 aa  559  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.97 
 
 		 1175 aa  548  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  31.75 
 
 		 1186 aa  548  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.59 
 
 		 1176 aa  532  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 		 1176 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  32.59 
 
 		 1184 aa  530  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  29.44 
 
 		 1187 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1176 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  30.46 
 
 		 1199 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.54 
 
 		 1199 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  29.85 
 
 		 1191 aa  513  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  30.76 
 
 		 1199 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 		 1177 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 		 1204 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  28.67 
 
 		 1173 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 		 1301 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  28.35 
 
 		 1255 aa  473  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  31.57 
 
 		 1164 aa  454  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  39.59 
 
 		 1190 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 		 1179 aa  446  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  31.09 
 
 		 1178 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 		 1181 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  30.02 
 
 		 1170 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.93 
 
 		 1185 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  28.56 
 
 		 1174 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 		 1403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  26.75 
 
 		 1168 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 		 1176 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.98 
 
 		 1170 aa  405  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 		 1169 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.11 
 
 		 1169 aa  402  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  29.24 
 
 		 1179 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  30.39 
 
 		 1180 aa  397  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 		 1186 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  26.19 
 
 		 1198 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  26.29 
 
 		 1164 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1167 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  25.14 
 
 		 1167 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  27.13 
 
 		 1190 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 		 1167 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  25.36 
 
 		 1162 aa  367  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 		 1167 aa  366  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 		 1167 aa  365  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  30.09 
 
 		 1153 aa  361  5e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 		 1184 aa  355  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 		 1152 aa  354  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.13 
 
 		 1174 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  28.68 
 
 		 1172 aa  329  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  28.03 
 
 		 1189 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 		 1171 aa  320  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.12 
 
 		 1134 aa  316  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  27.93 
 
 		 1189 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  26.6 
 
 		 1308 aa  314  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.74 
 
 		 1189 aa  314  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.4 
 
 		 1175 aa  313  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  61.37 
 
 		 1185 aa  311  5.9999999999999995e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.42 
 
 		 1188 aa  310  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  26.62 
 
 		 1189 aa  304  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.61 
 
 		 1149 aa  302  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1175 aa  298  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  27.81 
 
 		 1189 aa  297  7e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.02 
 
 		 1146 aa  291  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  24.02 
 
 		 1146 aa  290  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 		 1185 aa  287  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 		 1191 aa  283  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  28.51 
 
 		 1188 aa  283  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  27.33 
 
 		 1198 aa  281  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1174 aa  276  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  37.87 
 
 		 1184 aa  275  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  24.17 
 
 		 1147 aa  273  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  43.31 
 
 		 1214 aa  273  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>