More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0709 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 379 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  41.42 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  45.19 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  38.35 
 
 		 1123 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  38.25 
 
 		 1000 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 969 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 		 1108 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.65 
 
 		 1014 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.8 
 
 		 1158 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  38.31 
 
 		 1733 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 996 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.52 
 
 		 950 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  35.8 
 
 		 378 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.87 
 
 		 1025 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 990 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 654 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 268 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  35.56 
 
 		 262 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  34.1 
 
 		 252 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  35.4 
 
 		 1118 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  37.96 
 
 		 1004 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  34.12 
 
 		 1699 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.05 
 
 		 1339 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 1030 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 940 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 968 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 981 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.69 
 
 		 1021 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 1186 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  40.6 
 
 		 1005 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 921 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  38 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.56 
 
 		 1022 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  37.9 
 
 		 1121 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  29.81 
 
 		 993 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.74 
 
 		 1150 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 621 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 268 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32.56 
 
 		 621 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 1025 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.32 
 
 		 919 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  35.34 
 
 		 833 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.77 
 
 		 957 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  31.73 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 		 1100 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36 
 
 		 921 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  31.5 
 
 		 1010 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 1003 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.84 
 
 		 928 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  39.52 
 
 		 1123 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.01 
 
 		 960 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  32.3 
 
 		 535 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 1020 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 666 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.04 
 
 		 943 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.29 
 
 		 1018 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  34.96 
 
 		 1017 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.18 
 
 		 1102 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  39.85 
 
 		 1146 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.46 
 
 		 1027 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  36 
 
 		 979 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.86 
 
 		 993 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.65 
 
 		 1013 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  32.79 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.12 
 
 		 1048 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 1088 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 989 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 1072 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 628 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 982 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.15 
 
 		 1110 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.93 
 
 		 965 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 952 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  34.62 
 
 		 1090 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 622 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 1058 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.89 
 
 		 1092 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.27 
 
 		 496 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.84 
 
 		 1017 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 970 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 1036 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 655 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.83 
 
 		 1056 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 760 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.4 
 
 		 941 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 963 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.6 
 
 		 1022 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.46 
 
 		 983 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 282 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 1033 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  32.43 
 
 		 1071 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  30.75 
 
 		 964 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 582 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 1141 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 1030 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34 
 
 		 943 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>