More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3418 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  39.49 
 
 		 1161 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  57.46 
 
 		 1051 aa  1212    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  92.01 
 
 		 1076 aa  1998    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1076 aa  2199    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  69.78 
 
 		 1076 aa  1453    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  42.66 
 
 		 1038 aa  815    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  52.63 
 
 		 1155 aa  1059    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  38.45 
 
 		 1114 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  38.18 
 
 		 1037 aa  621  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  36.87 
 
 		 1117 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1113 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 		 1029 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  35.94 
 
 		 1181 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 		 1038 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1177 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.18 
 
 		 1008 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  36.31 
 
 		 1124 aa  549  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36.19 
 
 		 1128 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 1000 aa  539  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1132 aa  539  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1155 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 1071 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 1050 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1006 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.54 
 
 		 1039 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1066 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1027 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 982 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1028 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.6 
 
 		 1041 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 996 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1017 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 994 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1103 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1053 aa  515  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1051 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  36.24 
 
 		 1034 aa  512  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 1019 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1097 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1012 aa  509  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 1163 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1042 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1039 aa  503  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1006 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1096 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1010 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1010 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 1043 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1102 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1122 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1116 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 996 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 1014 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 1071 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1059 aa  489  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1147 aa  489  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1137 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 989 aa  484  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1129 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1041 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 1026 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 986 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1168 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1075 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 986 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1079 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1064 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1152 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1148 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1081 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1023 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 1013 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1150 aa  476  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 1140 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1006 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 1144 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 1080 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.92 
 
 		 1063 aa  473  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1154 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1040 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1105 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1023 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 999 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  31.72 
 
 		 1019 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1202 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 1025 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1060 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1071 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1014 aa  452  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1079 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.99 
 
 		 1023 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1173 aa  453  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1168 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 1189 aa  453  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1082 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1119 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1087 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1023 aa  450  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 1034 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>