More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1535 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 682 aa  1389    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  51.52 
 
 		 1210 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  51 
 
 		 449 aa  336  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 892 aa  334  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 819 aa  306  7e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 492 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  49.52 
 
 		 704 aa  290  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 834 aa  251  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  39.68 
 
 		 1248 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  47.16 
 
 		 754 aa  243  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  44.75 
 
 		 657 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  45.78 
 
 		 1182 aa  242  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 945 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 727 aa  236  9e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  43.37 
 
 		 676 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 886 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  44.12 
 
 		 918 aa  231  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 991 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 936 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 746 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  37.58 
 
 		 783 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  47.22 
 
 		 800 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  46.46 
 
 		 1289 aa  205  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 964 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 1047 aa  203  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 815 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 572 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 771 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 1676 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.52 
 
 		 744 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 1093 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 1093 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 547 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 462 aa  183  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 1654 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 665 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 788 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 723 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 945 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  29.49 
 
 		 767 aa  173  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 3706 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 767 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 1714 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 215 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 932 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 628 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 551 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 1560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 639 aa  165  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 347 aa  165  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 839 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 941 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 716 aa  164  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 681 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 1246 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 1253 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 613 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 732 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 1177 aa  156  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 382 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 947 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 479 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 782 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 1239 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 872 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 1044 aa  152  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 1390 aa  151  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 2693 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 962 aa  147  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.38 
 
 		 1668 aa  146  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  32.08 
 
 		 622 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.82 
 
 		 1663 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 980 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 526 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 913 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 752 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 638 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 813 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 771 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 909 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 746 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 1051 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1183 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 1093 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 674 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 749 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 532 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 1051 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 878 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 524 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 1166 aa  131  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 739 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 545 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 698 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 856 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 832 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 739 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>