189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1021 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 582 aa  1212    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 599 aa  150  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 571 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 615 aa  143  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 629 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 531 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 561 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 587 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 531 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 568 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 615 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 625 aa  97.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 638 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  31.64 
 
 		 642 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 630 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 639 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 548 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 584 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  31.03 
 
 		 629 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 626 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  36.96 
 
 		 646 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 594 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 636 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 487 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  32.18 
 
 		 638 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 627 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  36.92 
 
 		 666 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  22.59 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  39.42 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 677 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 		 631 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 620 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  21.99 
 
 		 540 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  22.95 
 
 		 579 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 633 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  33.55 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  31.89 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 478 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  32.08 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  33.11 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  35.81 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  33.78 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  33.77 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  34.42 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  22.27 
 
 		 581 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  30.17 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  23.11 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  45.07 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  33.99 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  34.42 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  43.66 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  22.08 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  41.25 
 
 		 453 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 484 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 601 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 555 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  32.7 
 
 		 490 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  42.86 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 574 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 531 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 577 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 477 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  23.04 
 
 		 611 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  22.54 
 
 		 579 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>