117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1020 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1020  hypothetical protein  100 
 
 		 936 aa  1945    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00854238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1820  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 877 aa  319  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0763  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 891 aa  147  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 828 aa  68.2  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 988 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 845 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 776 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 836 aa  62.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  29.5 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 810 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1081 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.66 
 
 		 833 aa  57  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  27.86 
 
 		 872 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 793 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 818 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 888 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1059 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 798 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 943 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1108 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 785 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  24.88 
 
 		 800 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 1001 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1036 aa  54.7  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 753 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 933 aa  54.7  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 866 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1077 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 809 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1047 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1082 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  25.19 
 
 		 856 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 986 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1013 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  24.01 
 
 		 783 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  33.7 
 
 		 843 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 824 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  28 
 
 		 1052 aa  51.6  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1006 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  29.46 
 
 		 925 aa  51.2  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1008 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 907 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 809 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 962 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  27.6 
 
 		 803 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1063 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 775 aa  51.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 812 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 882 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 1087 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 1004 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 920 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  24.18 
 
 		 808 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  27.35 
 
 		 799 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 795 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 828 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 1097 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1075 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 1050 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 791 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1006 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 794 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 952 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 747 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.5 
 
 		 805 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  24.52 
 
 		 1058 aa  48.9  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 994 aa  48.9  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 750 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 1135 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 932 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 817 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 791 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1086 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 979 aa  47.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 814 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 778 aa  47.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 791 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  21.31 
 
 		 1027 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 793 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  22.7 
 
 		 748 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 772 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 828 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1066 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1073 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 797 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 781 aa  46.6  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1092 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1088 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 854 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 772 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1014 aa  47  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1036 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  32.5 
 
 		 807 aa  46.2  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  25.78 
 
 		 986 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1122 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  27.36 
 
 		 854 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 829 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.62 
 
 		 946 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 1080 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>