117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4699 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 799 aa  1628    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 847 aa  317  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 820 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 817 aa  283  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 827 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 805 aa  267  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 813 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 806 aa  258  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 818 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 725 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 816 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 805 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 795 aa  217  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  28.94 
 
 		 709 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 814 aa  214  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 705 aa  210  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 821 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 611 aa  203  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 897 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 883 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 808 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 794 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 810 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 813 aa  184  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 818 aa  183  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.18 
 
 		 805 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 793 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 866 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 766 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 817 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 791 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 830 aa  171  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 		 820 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 934 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 822 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 824 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 828 aa  161  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  23.63 
 
 		 815 aa  161  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 812 aa  160  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 802 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 813 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 804 aa  155  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 829 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 973 aa  151  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 869 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 853 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 852 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 819 aa  144  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 826 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 812 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 832 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 800 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 748 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 803 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 814 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  21.94 
 
 		 772 aa  114  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 823 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.37 
 
 		 894 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 810 aa  94.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 705 aa  94  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  28.11 
 
 		 952 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.59 
 
 		 715 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  27.91 
 
 		 904 aa  74.7  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  28.89 
 
 		 926 aa  74.7  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  27.66 
 
 		 921 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 998 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28.83 
 
 		 961 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  28.49 
 
 		 924 aa  70.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 817 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25 
 
 		 887 aa  67.4  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  26.14 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  27.39 
 
 		 908 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.9 
 
 		 946 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  22.92 
 
 		 920 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 789 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1067 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  25.98 
 
 		 929 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 782 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  23.93 
 
 		 930 aa  57.4  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.23 
 
 		 891 aa  56.6  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  26.62 
 
 		 929 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 852 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 769 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  23.51 
 
 		 944 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 785 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.26 
 
 		 707 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 907 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1071 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 708 aa  52.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  25.82 
 
 		 965 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1075 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1074 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 812 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 793 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 1011 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 809 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  24.64 
 
 		 895 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  20.56 
 
 		 915 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 771 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  25.7 
 
 		 995 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>