124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3034 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  44.96 
 
 		 1088 aa  922    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  38.94 
 
 		 1208 aa  731    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  39.25 
 
 		 1166 aa  740    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  45.78 
 
 		 1172 aa  929    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  42.69 
 
 		 1126 aa  794    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  40.98 
 
 		 1120 aa  765    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  39.64 
 
 		 1113 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  39.56 
 
 		 1098 aa  709    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  40.24 
 
 		 1161 aa  736    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 1129 aa  2326    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  48.33 
 
 		 1127 aa  991    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  39.11 
 
 		 1183 aa  725    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  41.06 
 
 		 1098 aa  773    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  37.31 
 
 		 1203 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  61.59 
 
 		 1109 aa  1370    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  38.07 
 
 		 1107 aa  625  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.99 
 
 		 1114 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.72 
 
 		 1246 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.83 
 
 		 1228 aa  491  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.55 
 
 		 1170 aa  482  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.56 
 
 		 1236 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.76 
 
 		 1192 aa  470  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.94 
 
 		 1226 aa  462  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.7 
 
 		 1225 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.67 
 
 		 1208 aa  459  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.6 
 
 		 1193 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.15 
 
 		 1189 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.96 
 
 		 556 aa  181  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  28.5 
 
 		 649 aa  181  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  26.5 
 
 		 593 aa  180  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  28.84 
 
 		 604 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.86 
 
 		 596 aa  175  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  29.53 
 
 		 573 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.43 
 
 		 593 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.43 
 
 		 1066 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.94 
 
 		 583 aa  152  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.66 
 
 		 600 aa  149  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  30.13 
 
 		 562 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.7 
 
 		 566 aa  142  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.46 
 
 		 546 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  28.15 
 
 		 585 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.58 
 
 		 573 aa  132  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.32 
 
 		 604 aa  132  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  24.65 
 
 		 577 aa  125  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.17 
 
 		 574 aa  117  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.07 
 
 		 737 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.88 
 
 		 569 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.73 
 
 		 551 aa  114  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  24.73 
 
 		 803 aa  110  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  24.25 
 
 		 521 aa  106  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.26 
 
 		 554 aa  101  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  23.9 
 
 		 951 aa  101  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1127 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.44 
 
 		 668 aa  99.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.65 
 
 		 1040 aa  97.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1575 aa  94.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.93 
 
 		 645 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  25.61 
 
 		 492 aa  91.7  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.53 
 
 		 638 aa  90.9  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.87 
 
 		 453 aa  89  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.98 
 
 		 526 aa  88.6  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  24.95 
 
 		 499 aa  88.6  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  29.62 
 
 		 574 aa  86.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.32 
 
 		 655 aa  84.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.63 
 
 		 730 aa  84  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  23.85 
 
 		 655 aa  81.6  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  22.08 
 
 		 657 aa  75.1  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.94 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.53 
 
 		 585 aa  73.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  24.43 
 
 		 685 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.44 
 
 		 657 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  22.07 
 
 		 667 aa  73.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  24.43 
 
 		 685 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  22.69 
 
 		 658 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  27.95 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  28.27 
 
 		 691 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  27.48 
 
 		 664 aa  63.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.56 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.85 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.41 
 
 		 1126 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  29.46 
 
 		 447 aa  60.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  26.59 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32.48 
 
 		 3197 aa  58.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.75 
 
 		 1838 aa  58.2  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  32.05 
 
 		 878 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  23.61 
 
 		 566 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  25.91 
 
 		 645 aa  55.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  25 
 
 		 974 aa  53.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  27.73 
 
 		 506 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.72 
 
 		 8871 aa  53.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  29.18 
 
 		 2059 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  29.18 
 
 		 2035 aa  53.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  33.33 
 
 		 681 aa  52.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1289 aa  51.6  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.74 
 
 		 1557 aa  50.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.2 
 
 		 1490 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.65 
 
 		 2807 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0895  FG-GAP repeat-containing protein  26.61 
 
 		 568 aa  50.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  24.02 
 
 		 872 aa  50.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  28.04 
 
 		 524 aa  50.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>