250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0998 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 544 aa  1111    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  38.8 
 
 		 594 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  32.57 
 
 		 542 aa  236  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  33.1 
 
 		 560 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  33.16 
 
 		 551 aa  210  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  31.9 
 
 		 574 aa  173  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 608 aa  173  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 548 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 537 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 556 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 610 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 549 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 583 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 573 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  29.87 
 
 		 533 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 633 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 565 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 555 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 523 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 483 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  24.78 
 
 		 530 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.02 
 
 		 499 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  32.49 
 
 		 624 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.8 
 
 		 460 aa  97.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  27.55 
 
 		 532 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 480 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 476 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 511 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 494 aa  91.3  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  27.8 
 
 		 534 aa  90.5  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 514 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.18 
 
 		 494 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 534 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 480 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 514 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 515 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 478 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 530 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 483 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  40.8 
 
 		 557 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  23.5 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  37.31 
 
 		 604 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 603 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 521 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 664 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.16 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.47 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  23.63 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 527 aa  76.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  27.68 
 
 		 667 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.38 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  31.28 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.27 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.34 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 512 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 598 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 588 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 582 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>