83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1509 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  65.02 
 
 		 241 aa  307  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  55.91 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  55.16 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  51.37 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  35.81 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  37.62 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  33.81 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3980  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00414076  normal  0.398554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  32.62 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 620 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 494 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  33.94 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 402 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  34.65 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  37.65 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 469 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  39.19 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 396 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 374 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 463 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 433 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  31.2 
 
 		 430 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  46.15 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 545 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 455 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 484 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  26.92 
 
 		 429 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  32.97 
 
 		 356 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 		 499 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 446 aa  48.5  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 		 1672 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 1687 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 455 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 422 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  38.33 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 448 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.97 
 
 		 462 aa  46.6  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 485 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  33.93 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  38.89 
 
 		 555 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4368  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 632 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 556 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  40 
 
 		 756 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  33.93 
 
 		 377 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 423 aa  45.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 313 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 492 aa  45.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  38.24 
 
 		 382 aa  45.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2011  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2380  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 467 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  41.79 
 
 		 705 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 480 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 480 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 433 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 478 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.702449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 423 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.08 
 
 		 475 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  27.48 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 471 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 561 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 		 448 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  28.99 
 
 		 483 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 138 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 458 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 622 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 489 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>