226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2078 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 530 aa  1098    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  34.29 
 
 		 509 aa  203  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 556 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 561 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 565 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 537 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 548 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 483 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 549 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 594 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 533 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 477 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 574 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 476 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 544 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 494 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 501 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 551 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 513 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 560 aa  97.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 484 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  24.83 
 
 		 557 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.45 
 
 		 494 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 542 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 481 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.19 
 
 		 490 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 460 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 477 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 497 aa  90.5  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 522 aa  90.5  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.95 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 486 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 503 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  22.52 
 
 		 588 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 534 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 507 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.57 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  30.83 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.68 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 592 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 582 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 499 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 601 aa  78.2  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  25.32 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  22.63 
 
 		 582 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  22.54 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 604 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  22.81 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.62 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 486 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  22.04 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 511 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  24.04 
 
 		 531 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 613 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 557 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 531 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 		 598 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 579 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  23.34 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  21.94 
 
 		 523 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  22.09 
 
 		 492 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  23.37 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 608 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  23.46 
 
 		 599 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 592 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  42.7 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  22.65 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>