More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2302 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 1144 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  39.02 
 
 		 1017 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1168 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  39.32 
 
 		 1077 aa  758    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  38.41 
 
 		 1034 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  37.53 
 
 		 1102 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  37.89 
 
 		 1006 aa  660    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1096 aa  2233    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  36.52 
 
 		 996 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  36.62 
 
 		 1034 aa  626  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  36.82 
 
 		 986 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  36.59 
 
 		 979 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.64 
 
 		 1161 aa  595  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1147 aa  592  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  36.23 
 
 		 1042 aa  591  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1122 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  37.28 
 
 		 1013 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 1106 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1155 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1097 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1148 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 1050 aa  569  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 1038 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1117 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 1037 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1114 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1087 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  35.98 
 
 		 1155 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 1038 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1177 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1152 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 993 aa  539  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1128 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 1029 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1124 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  34.8 
 
 		 1050 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1076 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1028 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 982 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1132 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1181 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1076 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1006 aa  516  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.5 
 
 		 1023 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1033 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1008 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1079 aa  512  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1006 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 1027 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.49 
 
 		 1012 aa  509  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1081 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1051 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1146 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1037 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 1071 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 996 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1163 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 1008 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  33.46 
 
 		 1030 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 994 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 1019 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 1060 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 1076 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1116 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1177 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 1026 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1051 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1025 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 1189 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1071 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1173 aa  478  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1039 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1000 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.51 
 
 		 1041 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1066 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1129 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1150 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1059 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 1043 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1048 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1010 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1127 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1023 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1179 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1023 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 986 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1202 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1079 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1164 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1053 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1096 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1075 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1071 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1058 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1039 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1154 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1010 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1066 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1049 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1154 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>